Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms