Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HACD1B0YJ81 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD1B0YJ81 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD1B0YJ81 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD1B0YJ81 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD1B0YJ81 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD1B0YJ81 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD1B0YJ81 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD1B0YJ81 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD1B0YJ81 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms