Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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RABGGTAQ92696 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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RABGGTAQ92696 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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RABGGTAQ92696 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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RABGGTAQ92696 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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RABGGTAQ92696 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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RABGGTAQ92696 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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RABGGTAQ92696 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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