Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms