Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms