Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms