Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LRRC3Q9BY71 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LRRC3Q9BY71 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LRRC3Q9BY71 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC3Q9BY71 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms