Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAMK2DQ13557 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms