Protein–RNA interactions for Protein: Q6EMB2

TTLL5, Tubulin polyglutamylase TTLL5, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL5Q6EMB2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL5Q6EMB2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL5Q6EMB2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms