Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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SGCAQ16586 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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SGCAQ16586 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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SGCAQ16586 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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SGCAQ16586 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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SGCAQ16586 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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SGCAQ16586 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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