Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms