Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
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