Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NCOA3Q9Y6Q9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NCOA3Q9Y6Q9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NCOA3Q9Y6Q9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NCOA3Q9Y6Q9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NCOA3Q9Y6Q9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
NCOA3Q9Y6Q9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NCOA3Q9Y6Q9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NCOA3Q9Y6Q9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NCOA3Q9Y6Q9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NCOA3Q9Y6Q9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
NCOA3Q9Y6Q9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
NCOA3Q9Y6Q9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NCOA3Q9Y6Q9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NCOA3Q9Y6Q9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NCOA3Q9Y6Q9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NCOA3Q9Y6Q9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NCOA3Q9Y6Q9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NCOA3Q9Y6Q9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
NCOA3Q9Y6Q9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NCOA3Q9Y6Q9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NCOA3Q9Y6Q9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
NCOA3Q9Y6Q9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NCOA3Q9Y6Q9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NCOA3Q9Y6Q9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NCOA3Q9Y6Q9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NCOA3Q9Y6Q9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NCOA3Q9Y6Q9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NCOA3Q9Y6Q9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NCOA3Q9Y6Q9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NCOA3Q9Y6Q9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
NCOA3Q9Y6Q9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NCOA3Q9Y6Q9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NCOA3Q9Y6Q9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NCOA3Q9Y6Q9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
NCOA3Q9Y6Q9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NCOA3Q9Y6Q9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NCOA3Q9Y6Q9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NCOA3Q9Y6Q9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.25
NCOA3Q9Y6Q9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
NCOA3Q9Y6Q9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NCOA3Q9Y6Q9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NCOA3Q9Y6Q9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NCOA3Q9Y6Q9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NCOA3Q9Y6Q9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NCOA3Q9Y6Q9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NCOA3Q9Y6Q9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
NCOA3Q9Y6Q9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
NCOA3Q9Y6Q9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NCOA3Q9Y6Q9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NCOA3Q9Y6Q9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NCOA3Q9Y6Q9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NCOA3Q9Y6Q9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NCOA3Q9Y6Q9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NCOA3Q9Y6Q9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NCOA3Q9Y6Q9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NCOA3Q9Y6Q9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NCOA3Q9Y6Q9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NCOA3Q9Y6Q9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NCOA3Q9Y6Q9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NCOA3Q9Y6Q9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NCOA3Q9Y6Q9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NCOA3Q9Y6Q9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NCOA3Q9Y6Q9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NCOA3Q9Y6Q9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
NCOA3Q9Y6Q9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NCOA3Q9Y6Q9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NCOA3Q9Y6Q9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NCOA3Q9Y6Q9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NCOA3Q9Y6Q9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NCOA3Q9Y6Q9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NCOA3Q9Y6Q9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NCOA3Q9Y6Q9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NCOA3Q9Y6Q9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NCOA3Q9Y6Q9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NCOA3Q9Y6Q9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NCOA3Q9Y6Q9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NCOA3Q9Y6Q9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NCOA3Q9Y6Q9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NCOA3Q9Y6Q9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NCOA3Q9Y6Q9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NCOA3Q9Y6Q9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NCOA3Q9Y6Q9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NCOA3Q9Y6Q9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NCOA3Q9Y6Q9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NCOA3Q9Y6Q9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NCOA3Q9Y6Q9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
NCOA3Q9Y6Q9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NCOA3Q9Y6Q9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NCOA3Q9Y6Q9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NCOA3Q9Y6Q9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NCOA3Q9Y6Q9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NCOA3Q9Y6Q9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NCOA3Q9Y6Q9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms