Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLF12Q9Y4X4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF12Q9Y4X4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF12Q9Y4X4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.9 ms