Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B4

SF3B6, Splicing factor 3B subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B6Q9Y3B4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3B6Q9Y3B4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3B6Q9Y3B4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SF3B6Q9Y3B4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SF3B6Q9Y3B4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SF3B6Q9Y3B4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SF3B6Q9Y3B4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SF3B6Q9Y3B4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SF3B6Q9Y3B4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SF3B6Q9Y3B4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SF3B6Q9Y3B4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SF3B6Q9Y3B4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3B6Q9Y3B4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3B6Q9Y3B4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3B6Q9Y3B4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3B6Q9Y3B4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3B6Q9Y3B4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3B6Q9Y3B4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3B6Q9Y3B4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3B6Q9Y3B4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3B6Q9Y3B4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3B6Q9Y3B4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3B6Q9Y3B4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3B6Q9Y3B4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3B6Q9Y3B4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3B6Q9Y3B4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3B6Q9Y3B4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3B6Q9Y3B4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3B6Q9Y3B4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3B6Q9Y3B4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3B6Q9Y3B4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3B6Q9Y3B4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3B6Q9Y3B4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3B6Q9Y3B4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3B6Q9Y3B4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3B6Q9Y3B4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SF3B6Q9Y3B4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3B6Q9Y3B4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3B6Q9Y3B4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3B6Q9Y3B4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3B6Q9Y3B4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3B6Q9Y3B4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3B6Q9Y3B4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3B6Q9Y3B4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3B6Q9Y3B4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SF3B6Q9Y3B4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SF3B6Q9Y3B4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SF3B6Q9Y3B4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SF3B6Q9Y3B4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SF3B6Q9Y3B4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SF3B6Q9Y3B4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SF3B6Q9Y3B4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3B6Q9Y3B4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3B6Q9Y3B4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3B6Q9Y3B4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3B6Q9Y3B4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3B6Q9Y3B4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3B6Q9Y3B4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3B6Q9Y3B4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3B6Q9Y3B4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3B6Q9Y3B4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3B6Q9Y3B4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3B6Q9Y3B4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms