Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHKBQ9Y259 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHKBQ9Y259 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHKBQ9Y259 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHKBQ9Y259 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHKBQ9Y259 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHKBQ9Y259 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHKBQ9Y259 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHKBQ9Y259 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHKBQ9Y259 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHKBQ9Y259 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHKBQ9Y259 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CHKBQ9Y259 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHKBQ9Y259 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHKBQ9Y259 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHKBQ9Y259 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHKBQ9Y259 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHKBQ9Y259 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHKBQ9Y259 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHKBQ9Y259 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHKBQ9Y259 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHKBQ9Y259 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHKBQ9Y259 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms