Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TUBE1Q9UJT0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TUBE1Q9UJT0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TUBE1Q9UJT0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
TUBE1Q9UJT0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TUBE1Q9UJT0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TUBE1Q9UJT0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TUBE1Q9UJT0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TUBE1Q9UJT0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TUBE1Q9UJT0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TUBE1Q9UJT0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TUBE1Q9UJT0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TUBE1Q9UJT0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TUBE1Q9UJT0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TUBE1Q9UJT0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TUBE1Q9UJT0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TUBE1Q9UJT0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBE1Q9UJT0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBE1Q9UJT0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBE1Q9UJT0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBE1Q9UJT0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBE1Q9UJT0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TUBE1Q9UJT0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TUBE1Q9UJT0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TUBE1Q9UJT0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TUBE1Q9UJT0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TUBE1Q9UJT0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TUBE1Q9UJT0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TUBE1Q9UJT0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TUBE1Q9UJT0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TUBE1Q9UJT0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TUBE1Q9UJT0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TUBE1Q9UJT0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TUBE1Q9UJT0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TUBE1Q9UJT0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TUBE1Q9UJT0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TUBE1Q9UJT0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TUBE1Q9UJT0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TUBE1Q9UJT0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TUBE1Q9UJT0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TUBE1Q9UJT0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TUBE1Q9UJT0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TUBE1Q9UJT0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TUBE1Q9UJT0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TUBE1Q9UJT0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TUBE1Q9UJT0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TUBE1Q9UJT0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUBE1Q9UJT0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms