Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEFF2Q9UIK5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEFF2Q9UIK5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEFF2Q9UIK5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEFF2Q9UIK5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEFF2Q9UIK5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEFF2Q9UIK5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEFF2Q9UIK5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEFF2Q9UIK5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEFF2Q9UIK5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEFF2Q9UIK5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEFF2Q9UIK5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEFF2Q9UIK5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEFF2Q9UIK5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEFF2Q9UIK5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEFF2Q9UIK5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEFF2Q9UIK5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEFF2Q9UIK5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEFF2Q9UIK5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms