Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNAL1Q9UBT7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNAL1Q9UBT7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNAL1Q9UBT7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNAL1Q9UBT7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNAL1Q9UBT7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNAL1Q9UBT7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNAL1Q9UBT7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNAL1Q9UBT7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNAL1Q9UBT7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNAL1Q9UBT7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNAL1Q9UBT7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNAL1Q9UBT7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNAL1Q9UBT7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNAL1Q9UBT7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNAL1Q9UBT7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNAL1Q9UBT7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNAL1Q9UBT7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNAL1Q9UBT7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTNNAL1Q9UBT7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTNNAL1Q9UBT7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNAL1Q9UBT7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTNNAL1Q9UBT7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNAL1Q9UBT7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNAL1Q9UBT7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNAL1Q9UBT7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNAL1Q9UBT7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNAL1Q9UBT7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNAL1Q9UBT7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNNAL1Q9UBT7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNNAL1Q9UBT7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNAL1Q9UBT7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNAL1Q9UBT7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNAL1Q9UBT7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNAL1Q9UBT7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNAL1Q9UBT7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNAL1Q9UBT7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNAL1Q9UBT7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNAL1Q9UBT7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNNAL1Q9UBT7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNNAL1Q9UBT7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNNAL1Q9UBT7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNNAL1Q9UBT7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTNNAL1Q9UBT7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTNNAL1Q9UBT7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNNAL1Q9UBT7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNNAL1Q9UBT7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.3 ms