Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC52.51■■■■■ 6
CCDC180Q9P1Z9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC52.5■■■■■ 6
CCDC180Q9P1Z9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.49■■■■■ 5.99
CCDC180Q9P1Z9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.48■■■■■ 5.99
CCDC180Q9P1Z9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC52.48■■■■■ 5.99
CCDC180Q9P1Z9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC52.48■■■■■ 5.99
CCDC180Q9P1Z9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC52.47■■■■■ 5.99
CCDC180Q9P1Z9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC52.47■■■■■ 5.99
CCDC180Q9P1Z9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC52.47■■■■■ 5.99
CCDC180Q9P1Z9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.46■■■■■ 5.99
CCDC180Q9P1Z9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC52.45■■■■■ 5.99
CCDC180Q9P1Z9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC52.44■■■■■ 5.99
CCDC180Q9P1Z9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.44■■■■■ 5.99
CCDC180Q9P1Z9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC52.44■■■■■ 5.99
CCDC180Q9P1Z9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC52.44■■■■■ 5.98
CCDC180Q9P1Z9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC52.44■■■■■ 5.98
CCDC180Q9P1Z9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.43■■■■■ 5.98
CCDC180Q9P1Z9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC52.43■■■■■ 5.98
CCDC180Q9P1Z9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC52.43■■■■■ 5.98
CCDC180Q9P1Z9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC52.41■■■■■ 5.98
CCDC180Q9P1Z9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.41■■■■■ 5.98
CCDC180Q9P1Z9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC52.41■■■■■ 5.98
CCDC180Q9P1Z9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC52.41■■■■■ 5.98
CCDC180Q9P1Z9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.41■■■■■ 5.98
CCDC180Q9P1Z9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC52.4■■■■■ 5.98
CCDC180Q9P1Z9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC52.4■■■■■ 5.98
CCDC180Q9P1Z9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC52.39■■■■■ 5.98
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC52.39■■■■■ 5.98
CCDC180Q9P1Z9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC52.38■■■■■ 5.98
CCDC180Q9P1Z9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.38■■■■■ 5.98
CCDC180Q9P1Z9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.37■■■■■ 5.97
CCDC180Q9P1Z9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC52.37■■■■■ 5.97
CCDC180Q9P1Z9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC52.37■■■■■ 5.97
CCDC180Q9P1Z9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.36■■■■■ 5.97
CCDC180Q9P1Z9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC52.36■■■■■ 5.97
CCDC180Q9P1Z9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC52.36■■■■■ 5.97
CCDC180Q9P1Z9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.35■■■■■ 5.97
CCDC180Q9P1Z9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.35■■■■■ 5.97
CCDC180Q9P1Z9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.35■■■■■ 5.97
CCDC180Q9P1Z9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC52.35■■■■■ 5.97
CCDC180Q9P1Z9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.34■■■■■ 5.97
CCDC180Q9P1Z9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.34■■■■■ 5.97
CCDC180Q9P1Z9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.34■■■■■ 5.97
CCDC180Q9P1Z9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.33■■■■■ 5.97
CCDC180Q9P1Z9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.32■■■■■ 5.97
CCDC180Q9P1Z9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC52.31■■■■■ 5.96
CCDC180Q9P1Z9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC52.3■■■■■ 5.96
CCDC180Q9P1Z9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC52.3■■■■■ 5.96
CCDC180Q9P1Z9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC52.3■■■■■ 5.96
CCDC180Q9P1Z9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC52.3■■■■■ 5.96
CCDC180Q9P1Z9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.29■■■■■ 5.96
CCDC180Q9P1Z9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.29■■■■■ 5.96
CCDC180Q9P1Z9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC52.28■■■■■ 5.96
CCDC180Q9P1Z9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC52.28■■■■■ 5.96
CCDC180Q9P1Z9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC52.27■■■■■ 5.96
CCDC180Q9P1Z9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC52.27■■■■■ 5.96
CCDC180Q9P1Z9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC52.26■■■■■ 5.96
CCDC180Q9P1Z9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC52.26■■■■■ 5.96
CCDC180Q9P1Z9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC52.26■■■■■ 5.96
CCDC180Q9P1Z9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.26■■■■■ 5.96
CCDC180Q9P1Z9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC52.26■■■■■ 5.96
CCDC180Q9P1Z9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.25■■■■■ 5.95
CCDC180Q9P1Z9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.25■■■■■ 5.95
CCDC180Q9P1Z9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC52.23■■■■■ 5.95
CCDC180Q9P1Z9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.23■■■■■ 5.95
CCDC180Q9P1Z9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC52.23■■■■■ 5.95
CCDC180Q9P1Z9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC52.22■■■■■ 5.95
CCDC180Q9P1Z9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.22■■■■■ 5.95
CCDC180Q9P1Z9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC52.22■■■■■ 5.95
CCDC180Q9P1Z9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.22■■■■■ 5.95
CCDC180Q9P1Z9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC52.22■■■■■ 5.95
CCDC180Q9P1Z9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC52.22■■■■■ 5.95
CCDC180Q9P1Z9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC52.22■■■■■ 5.95
CCDC180Q9P1Z9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC52.2■■■■■ 5.95
CCDC180Q9P1Z9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.2■■■■■ 5.95
CCDC180Q9P1Z9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC52.2■■■■■ 5.95
CCDC180Q9P1Z9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.2■■■■■ 5.95
CCDC180Q9P1Z9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.19■■■■■ 5.95
CCDC180Q9P1Z9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC52.19■■■■■ 5.95
CCDC180Q9P1Z9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.18■■■■■ 5.94
CCDC180Q9P1Z9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC52.18■■■■■ 5.94
CCDC180Q9P1Z9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC52.18■■■■■ 5.94
CCDC180Q9P1Z9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC52.17■■■■■ 5.94
CCDC180Q9P1Z9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC52.16■■■■■ 5.94
CCDC180Q9P1Z9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC52.16■■■■■ 5.94
CCDC180Q9P1Z9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC52.15■■■■■ 5.94
CCDC180Q9P1Z9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC52.14■■■■■ 5.94
CCDC180Q9P1Z9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC52.13■■■■■ 5.93
CCDC180Q9P1Z9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.12■■■■■ 5.93
CCDC180Q9P1Z9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC52.12■■■■■ 5.93
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC52.12■■■■■ 5.93
CCDC180Q9P1Z9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.12■■■■■ 5.93
CCDC180Q9P1Z9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC52.12■■■■■ 5.93
CCDC180Q9P1Z9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.11■■■■■ 5.93
CCDC180Q9P1Z9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC52.11■■■■■ 5.93
CCDC180Q9P1Z9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.11■■■■■ 5.93
CCDC180Q9P1Z9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC52.11■■■■■ 5.93
CCDC180Q9P1Z9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.11■■■■■ 5.93
CCDC180Q9P1Z9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC52.1■■■■■ 5.93
CCDC180Q9P1Z9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC52.09■■■■■ 5.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms