Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL2Q9NX52 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL2Q9NX52 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDL2Q9NX52 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDL2Q9NX52 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RHBDL2Q9NX52 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDL2Q9NX52 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDL2Q9NX52 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDL2Q9NX52 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDL2Q9NX52 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDL2Q9NX52 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDL2Q9NX52 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDL2Q9NX52 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDL2Q9NX52 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDL2Q9NX52 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDL2Q9NX52 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDL2Q9NX52 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDL2Q9NX52 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDL2Q9NX52 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDL2Q9NX52 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDL2Q9NX52 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDL2Q9NX52 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDL2Q9NX52 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDL2Q9NX52 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDL2Q9NX52 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDL2Q9NX52 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL2Q9NX52 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL2Q9NX52 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL2Q9NX52 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL2Q9NX52 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL2Q9NX52 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHBDL2Q9NX52 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDL2Q9NX52 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDL2Q9NX52 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDL2Q9NX52 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL2Q9NX52 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL2Q9NX52 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL2Q9NX52 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL2Q9NX52 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL2Q9NX52 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDL2Q9NX52 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDL2Q9NX52 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDL2Q9NX52 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDL2Q9NX52 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDL2Q9NX52 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDL2Q9NX52 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDL2Q9NX52 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDL2Q9NX52 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDL2Q9NX52 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDL2Q9NX52 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDL2Q9NX52 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDL2Q9NX52 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDL2Q9NX52 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDL2Q9NX52 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDL2Q9NX52 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDL2Q9NX52 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDL2Q9NX52 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDL2Q9NX52 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDL2Q9NX52 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms