Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMBRD1Q9NUN5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMBRD1Q9NUN5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMBRD1Q9NUN5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMBRD1Q9NUN5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMBRD1Q9NUN5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMBRD1Q9NUN5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMBRD1Q9NUN5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMBRD1Q9NUN5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMBRD1Q9NUN5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LMBRD1Q9NUN5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMBRD1Q9NUN5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMBRD1Q9NUN5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LMBRD1Q9NUN5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
LMBRD1Q9NUN5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMBRD1Q9NUN5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMBRD1Q9NUN5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMBRD1Q9NUN5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMBRD1Q9NUN5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMBRD1Q9NUN5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LMBRD1Q9NUN5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMBRD1Q9NUN5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMBRD1Q9NUN5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMBRD1Q9NUN5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMBRD1Q9NUN5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMBRD1Q9NUN5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMBRD1Q9NUN5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMBRD1Q9NUN5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMBRD1Q9NUN5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMBRD1Q9NUN5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LMBRD1Q9NUN5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMBRD1Q9NUN5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMBRD1Q9NUN5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMBRD1Q9NUN5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMBRD1Q9NUN5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMBRD1Q9NUN5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMBRD1Q9NUN5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMBRD1Q9NUN5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LMBRD1Q9NUN5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMBRD1Q9NUN5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMBRD1Q9NUN5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMBRD1Q9NUN5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMBRD1Q9NUN5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LMBRD1Q9NUN5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMBRD1Q9NUN5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMBRD1Q9NUN5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMBRD1Q9NUN5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMBRD1Q9NUN5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMBRD1Q9NUN5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMBRD1Q9NUN5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMBRD1Q9NUN5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMBRD1Q9NUN5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMBRD1Q9NUN5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMBRD1Q9NUN5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMBRD1Q9NUN5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMBRD1Q9NUN5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMBRD1Q9NUN5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMBRD1Q9NUN5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
LMBRD1Q9NUN5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMBRD1Q9NUN5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMBRD1Q9NUN5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMBRD1Q9NUN5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMBRD1Q9NUN5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMBRD1Q9NUN5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMBRD1Q9NUN5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMBRD1Q9NUN5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms