Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RTN4Q9NQC3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RTN4Q9NQC3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RTN4Q9NQC3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RTN4Q9NQC3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RTN4Q9NQC3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTN4Q9NQC3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTN4Q9NQC3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTN4Q9NQC3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTN4Q9NQC3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RTN4Q9NQC3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTN4Q9NQC3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTN4Q9NQC3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTN4Q9NQC3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTN4Q9NQC3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTN4Q9NQC3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTN4Q9NQC3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTN4Q9NQC3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTN4Q9NQC3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTN4Q9NQC3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTN4Q9NQC3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTN4Q9NQC3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RTN4Q9NQC3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTN4Q9NQC3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTN4Q9NQC3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTN4Q9NQC3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTN4Q9NQC3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTN4Q9NQC3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTN4Q9NQC3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTN4Q9NQC3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RTN4Q9NQC3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTN4Q9NQC3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTN4Q9NQC3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTN4Q9NQC3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTN4Q9NQC3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTN4Q9NQC3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RTN4Q9NQC3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RTN4Q9NQC3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RTN4Q9NQC3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RTN4Q9NQC3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RTN4Q9NQC3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RTN4Q9NQC3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RTN4Q9NQC3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RTN4Q9NQC3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RTN4Q9NQC3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RTN4Q9NQC3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTN4Q9NQC3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTN4Q9NQC3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RTN4Q9NQC3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTN4Q9NQC3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTN4Q9NQC3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTN4Q9NQC3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTN4Q9NQC3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTN4Q9NQC3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTN4Q9NQC3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTN4Q9NQC3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTN4Q9NQC3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTN4Q9NQC3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTN4Q9NQC3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTN4Q9NQC3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTN4Q9NQC3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTN4Q9NQC3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTN4Q9NQC3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTN4Q9NQC3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTN4Q9NQC3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTN4Q9NQC3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTN4Q9NQC3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTN4Q9NQC3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTN4Q9NQC3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTN4Q9NQC3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTN4Q9NQC3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTN4Q9NQC3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms