Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLCO1B3Q9NPD5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLCO1B3Q9NPD5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLCO1B3Q9NPD5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLCO1B3Q9NPD5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLCO1B3Q9NPD5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLCO1B3Q9NPD5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLCO1B3Q9NPD5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLCO1B3Q9NPD5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLCO1B3Q9NPD5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLCO1B3Q9NPD5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLCO1B3Q9NPD5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLCO1B3Q9NPD5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLCO1B3Q9NPD5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLCO1B3Q9NPD5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLCO1B3Q9NPD5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLCO1B3Q9NPD5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLCO1B3Q9NPD5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLCO1B3Q9NPD5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLCO1B3Q9NPD5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLCO1B3Q9NPD5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLCO1B3Q9NPD5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLCO1B3Q9NPD5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLCO1B3Q9NPD5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLCO1B3Q9NPD5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLCO1B3Q9NPD5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLCO1B3Q9NPD5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLCO1B3Q9NPD5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLCO1B3Q9NPD5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLCO1B3Q9NPD5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLCO1B3Q9NPD5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLCO1B3Q9NPD5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLCO1B3Q9NPD5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLCO1B3Q9NPD5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLCO1B3Q9NPD5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLCO1B3Q9NPD5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLCO1B3Q9NPD5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLCO1B3Q9NPD5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLCO1B3Q9NPD5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLCO1B3Q9NPD5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLCO1B3Q9NPD5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLCO1B3Q9NPD5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLCO1B3Q9NPD5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLCO1B3Q9NPD5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLCO1B3Q9NPD5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLCO1B3Q9NPD5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLCO1B3Q9NPD5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLCO1B3Q9NPD5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLCO1B3Q9NPD5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLCO1B3Q9NPD5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLCO1B3Q9NPD5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLCO1B3Q9NPD5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLCO1B3Q9NPD5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLCO1B3Q9NPD5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLCO1B3Q9NPD5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO1B3Q9NPD5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO1B3Q9NPD5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO1B3Q9NPD5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO1B3Q9NPD5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO1B3Q9NPD5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO1B3Q9NPD5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLCO1B3Q9NPD5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLCO1B3Q9NPD5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLCO1B3Q9NPD5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms