Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNK9Q9NPC2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNK9Q9NPC2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNK9Q9NPC2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNK9Q9NPC2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNK9Q9NPC2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNK9Q9NPC2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNK9Q9NPC2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNK9Q9NPC2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNK9Q9NPC2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNK9Q9NPC2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNK9Q9NPC2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNK9Q9NPC2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNK9Q9NPC2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNK9Q9NPC2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNK9Q9NPC2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNK9Q9NPC2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNK9Q9NPC2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNK9Q9NPC2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNK9Q9NPC2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNK9Q9NPC2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNK9Q9NPC2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNK9Q9NPC2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNK9Q9NPC2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNK9Q9NPC2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNK9Q9NPC2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNK9Q9NPC2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNK9Q9NPC2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNK9Q9NPC2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNK9Q9NPC2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KCNK9Q9NPC2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KCNK9Q9NPC2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNK9Q9NPC2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNK9Q9NPC2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNK9Q9NPC2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNK9Q9NPC2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNK9Q9NPC2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNK9Q9NPC2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNK9Q9NPC2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNK9Q9NPC2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNK9Q9NPC2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNK9Q9NPC2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNK9Q9NPC2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNK9Q9NPC2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNK9Q9NPC2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNK9Q9NPC2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNK9Q9NPC2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNK9Q9NPC2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNK9Q9NPC2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNK9Q9NPC2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNK9Q9NPC2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNK9Q9NPC2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNK9Q9NPC2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNK9Q9NPC2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNK9Q9NPC2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNK9Q9NPC2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNK9Q9NPC2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNK9Q9NPC2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNK9Q9NPC2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNK9Q9NPC2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNK9Q9NPC2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNK9Q9NPC2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNK9Q9NPC2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNK9Q9NPC2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNK9Q9NPC2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNK9Q9NPC2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNK9Q9NPC2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms