Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREM1Q9NP99 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREM1Q9NP99 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms