Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NTN4Q9HB63 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NTN4Q9HB63 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NTN4Q9HB63 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NTN4Q9HB63 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NTN4Q9HB63 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTN4Q9HB63 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTN4Q9HB63 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTN4Q9HB63 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTN4Q9HB63 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTN4Q9HB63 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTN4Q9HB63 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTN4Q9HB63 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTN4Q9HB63 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTN4Q9HB63 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTN4Q9HB63 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTN4Q9HB63 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTN4Q9HB63 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTN4Q9HB63 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NTN4Q9HB63 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTN4Q9HB63 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTN4Q9HB63 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTN4Q9HB63 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTN4Q9HB63 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTN4Q9HB63 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NTN4Q9HB63 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NTN4Q9HB63 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NTN4Q9HB63 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NTN4Q9HB63 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTN4Q9HB63 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTN4Q9HB63 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTN4Q9HB63 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTN4Q9HB63 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTN4Q9HB63 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTN4Q9HB63 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTN4Q9HB63 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NTN4Q9HB63 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTN4Q9HB63 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTN4Q9HB63 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTN4Q9HB63 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTN4Q9HB63 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NTN4Q9HB63 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTN4Q9HB63 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTN4Q9HB63 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTN4Q9HB63 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTN4Q9HB63 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTN4Q9HB63 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTN4Q9HB63 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTN4Q9HB63 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTN4Q9HB63 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms