Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LIN28AQ9H9Z2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN28AQ9H9Z2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN28AQ9H9Z2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN28AQ9H9Z2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN28AQ9H9Z2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN28AQ9H9Z2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN28AQ9H9Z2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIN28AQ9H9Z2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIN28AQ9H9Z2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIN28AQ9H9Z2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIN28AQ9H9Z2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIN28AQ9H9Z2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LIN28AQ9H9Z2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIN28AQ9H9Z2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIN28AQ9H9Z2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIN28AQ9H9Z2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIN28AQ9H9Z2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LIN28AQ9H9Z2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN28AQ9H9Z2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN28AQ9H9Z2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN28AQ9H9Z2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN28AQ9H9Z2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LIN28AQ9H9Z2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LIN28AQ9H9Z2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LIN28AQ9H9Z2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LIN28AQ9H9Z2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LIN28AQ9H9Z2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIN28AQ9H9Z2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIN28AQ9H9Z2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIN28AQ9H9Z2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIN28AQ9H9Z2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIN28AQ9H9Z2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIN28AQ9H9Z2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LIN28AQ9H9Z2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIN28AQ9H9Z2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIN28AQ9H9Z2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIN28AQ9H9Z2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIN28AQ9H9Z2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIN28AQ9H9Z2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIN28AQ9H9Z2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIN28AQ9H9Z2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIN28AQ9H9Z2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIN28AQ9H9Z2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIN28AQ9H9Z2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIN28AQ9H9Z2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIN28AQ9H9Z2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIN28AQ9H9Z2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIN28AQ9H9Z2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIN28AQ9H9Z2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms