Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4K1

RIBC2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIBC2Q9H4K1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIBC2Q9H4K1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIBC2Q9H4K1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIBC2Q9H4K1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIBC2Q9H4K1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIBC2Q9H4K1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIBC2Q9H4K1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIBC2Q9H4K1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIBC2Q9H4K1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIBC2Q9H4K1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIBC2Q9H4K1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIBC2Q9H4K1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIBC2Q9H4K1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIBC2Q9H4K1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIBC2Q9H4K1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIBC2Q9H4K1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIBC2Q9H4K1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIBC2Q9H4K1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIBC2Q9H4K1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIBC2Q9H4K1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIBC2Q9H4K1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RIBC2Q9H4K1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIBC2Q9H4K1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIBC2Q9H4K1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIBC2Q9H4K1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RIBC2Q9H4K1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIBC2Q9H4K1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIBC2Q9H4K1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIBC2Q9H4K1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms