Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B1

FTO, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTOQ9C0B1 EXD3-202ENST00000460390 1432 ntTSL 221.33■■□□□ 1.017e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.87e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 SLC4A2-205ENST00000463414 793 ntTSL 319.68■□□□□ 0.747e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 SLC4A2-216ENST00000490898 702 ntTSL 318.5■□□□□ 0.557e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 SLC4A2-215ENST00000488420 610 ntTSL 318.31■□□□□ 0.527e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.57e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 GNA11-203ENST00000586763 354 ntTSL 318.13■□□□□ 0.497e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.477e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 C8orf82-203ENST00000527462 401 ntAPPRIS ALT2 TSL 317■□□□□ 0.317e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 SLC4A2-212ENST00000482950 500 ntTSL 416.93■□□□□ 0.37e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.219e-8■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 LINC00482-202ENST00000577000 461 ntTSL 316.16■□□□□ 0.187e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.047e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.057e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.087e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 SPTB-206ENST00000553938 3456 ntTSL 1 (best)14.47□□□□□ -0.097e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.177e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 SPTB-204ENST00000389722 10063 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.47e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 SPTB-208ENST00000556626 10153 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.567e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 SCAF8-202ENST00000367186 4908 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.567e-6■■■■□ 25.5
FTOQ9C0B1 CAPN15-207ENST00000568988 911 ntTSL 330.97■■■□□ 2.552e-6■■■■□ 25.4
FTOQ9C0B1 CAPN15-202ENST00000562370 942 ntTSL 230.97■■■□□ 2.552e-6■■■■□ 25.4
FTOQ9C0B1 CAPN15-208ENST00000637507 1482 ntTSL 524.76■■□□□ 1.552e-6■■■■□ 25.4
FTOQ9C0B1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.832e-6■■■■□ 25.4
FTOQ9C0B1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.111e-6■■■■□ 25.3
FTOQ9C0B1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.981e-6■■■■□ 25.3
FTOQ9C0B1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.731e-6■■■■□ 25.3
FTOQ9C0B1 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.431e-6■■■■□ 25.3
FTOQ9C0B1 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.391e-6■■■■□ 25.3
FTOQ9C0B1 C21orf58-210ENST00000491666 1196 ntTSL 516.68■□□□□ 0.261e-6■■■■□ 25.3
FTOQ9C0B1 C21orf58-206ENST00000417060 1072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)16.68■□□□□ 0.261e-6■■■■□ 25.3
FTOQ9C0B1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.262e-8■■■■□ 25.3
FTOQ9C0B1 RANBP1-210ENST00000435265 1879 ntTSL 222.47■■□□□ 1.192e-8■■■■□ 25.3
FTOQ9C0B1 RANBP1-203ENST00000411892 584 ntTSL 216.66■□□□□ 0.262e-8■■■■□ 25.3
FTOQ9C0B1 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.252e-8■■■■□ 25.3
FTOQ9C0B1 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.242e-8■■■■□ 25.3
FTOQ9C0B1 KDM4B-206ENST00000588361 3039 ntTSL 218.08■□□□□ 0.493e-6■■■■□ 25.2
FTOQ9C0B1 KDM4B-208ENST00000589104 3470 ntTSL 215.73■□□□□ 0.113e-6■■■■□ 25.2
FTOQ9C0B1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.844e-13■■■■□ 25.2
FTOQ9C0B1 GNB1-207ENST00000472614 708 ntTSL 225.5■■□□□ 1.674e-13■■■■□ 25.2
FTOQ9C0B1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.434e-13■■■■□ 25.2
FTOQ9C0B1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.34e-13■■■■□ 25.2
FTOQ9C0B1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.81e-13■■■■□ 25.2
FTOQ9C0B1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.341e-13■■■■□ 25.2
FTOQ9C0B1 PPP1CC-211ENST00000620030 582 ntTSL 227.05■■□□□ 1.921e-13■■■■□ 25.2
FTOQ9C0B1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.851e-13■■■■□ 25.2
FTOQ9C0B1 PPP1CC-209ENST00000551690 603 ntTSL 325.34■■□□□ 1.651e-13■■■■□ 25.2
FTOQ9C0B1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.371e-13■■■■□ 25.2
FTOQ9C0B1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 22e-6■■■■□ 25.2
FTOQ9C0B1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.592e-6■■■■□ 25.2
FTOQ9C0B1 TRIM13-203ENST00000378183 1251 ntTSL 223.02■■□□□ 1.289e-12■■■■□ 25.2
FTOQ9C0B1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.859e-12■■■■□ 25.2
FTOQ9C0B1 TRIM13-208ENST00000478111 478 ntTSL 219.44■□□□□ 0.79e-12■■■■□ 25.2
FTOQ9C0B1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.599e-12■■■■□ 25.2
FTOQ9C0B1 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.399e-12■■■■□ 25.2
FTOQ9C0B1 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.089e-12■■■■□ 25.2
FTOQ9C0B1 TRIM13-205ENST00000442421 692 ntTSL 515.11■□□□□ 0.019e-12■■■■□ 25.2
FTOQ9C0B1 TRIM13-207ENST00000474805 403 ntTSL 514.78□□□□□ -0.049e-12■■■■□ 25.2
FTOQ9C0B1 SOX9-201ENST00000245479 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.252e-6■■■■□ 25.2
FTOQ9C0B1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.553e-19■■■■□ 25.1
FTOQ9C0B1 DOT1L-203ENST00000452696 624 ntTSL 316.97■□□□□ 0.312e-6■■■■□ 24.8
FTOQ9C0B1 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 24.8
FTOQ9C0B1 PPP2R5C-216ENST00000556086 279 ntTSL 513.77□□□□□ -0.211e-9■■■■□ 24.8
FTOQ9C0B1 PPP2R5C-209ENST00000553890 492 ntTSL 313.01□□□□□ -0.331e-9■■■■□ 24.8
FTOQ9C0B1 PPP2R5C-206ENST00000553554 564 ntTSL 59.85□□□□□ -0.831e-9■■■■□ 24.8
FTOQ9C0B1 PPP2R5C-213ENST00000554504 448 ntTSL 36.5□□□□□ -1.371e-9■■■■□ 24.8
FTOQ9C0B1 KRT8-202ENST00000546542 765 ntTSL 320.34■□□□□ 0.855e-12■■■■□ 24.7
FTOQ9C0B1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.553e-7■■■■□ 24.6
FTOQ9C0B1 TLN1-202ENST00000378192 1693 ntTSL 213.56□□□□□ -0.244e-6■■■■□ 24.6
FTOQ9C0B1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.592e-6■■■■□ 24.5
FTOQ9C0B1 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.562e-6■■■■□ 24.5
FTOQ9C0B1 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.472e-6■■■■□ 24.5
FTOQ9C0B1 RAC2-207ENST00000481215 480 ntTSL 1 (best)13.38□□□□□ -0.272e-6■■■■□ 24.5
FTOQ9C0B1 RAC2-205ENST00000441619 705 ntTSL 510.44□□□□□ -0.742e-6■■■■□ 24.5
FTOQ9C0B1 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.53■□□□□ 0.082e-11■■■■□ 24.4
FTOQ9C0B1 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt12.63□□□□□ -0.392e-11■■■■□ 24.4
FTOQ9C0B1 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt12.42□□□□□ -0.422e-11■■■■□ 24.4
FTOQ9C0B1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.973e-8■■■■□ 24.4
FTOQ9C0B1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.053e-8■■■■□ 24.4
FTOQ9C0B1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.021e-6■■■■□ 24.4
FTOQ9C0B1 AGAP1-214ENST00000635100 2478 ntTSL 517.97■□□□□ 0.471e-6■■■■□ 24.4
FTOQ9C0B1 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.381e-6■■■■□ 24.4
FTOQ9C0B1 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.043e-8■■■■□ 24.4
FTOQ9C0B1 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.531e-6■■■■□ 24.4
FTOQ9C0B1 AGAP1-207ENST00000428334 10090 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.71e-6■■■■□ 24.4
FTOQ9C0B1 PLEC-213ENST00000528025 2115 ntTSL 522.63■■□□□ 1.212e-6■■■■□ 24.2
FTOQ9C0B1 PLEC-214ENST00000528131 564 ntTSL 321.51■■□□□ 1.032e-6■■■■□ 24.2
FTOQ9C0B1 PLEC-215ENST00000532346 316 ntTSL 317.71■□□□□ 0.432e-6■■■■□ 24.2
FTOQ9C0B1 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.363e-9■■■■□ 24.2
FTOQ9C0B1 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.433e-9■■■■□ 24.2
FTOQ9C0B1 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.473e-9■■■■□ 24.2
FTOQ9C0B1 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.543e-9■■■■□ 24.2
FTOQ9C0B1 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.563e-9■■■■□ 24.2
FTOQ9C0B1 RRBP1-205ENST00000398782 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 227.96■■■□□ 2.073e-8■■■■□ 24.2
FTOQ9C0B1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.233e-8■■■■□ 24.2
FTOQ9C0B1 HDLBP-218ENST00000441124 708 ntTSL 222.15■■□□□ 1.143e-8■■■■□ 24.2
FTOQ9C0B1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.053e-8■■■■□ 24.2
FTOQ9C0B1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.883e-8■■■■□ 24.2
FTOQ9C0B1 HDLBP-212ENST00000426343 594 ntTSL 420.41■□□□□ 0.863e-8■■■■□ 24.2
FTOQ9C0B1 HDLBP-208ENST00000422080 578 ntTSL 320.41■□□□□ 0.863e-8■■■■□ 24.2
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