Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NMES1Q9C002 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NMES1Q9C002 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms