Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP58Q9BVL2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP58Q9BVL2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP58Q9BVL2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP58Q9BVL2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP58Q9BVL2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP58Q9BVL2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP58Q9BVL2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP58Q9BVL2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP58Q9BVL2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP58Q9BVL2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP58Q9BVL2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP58Q9BVL2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NUP58Q9BVL2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP58Q9BVL2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP58Q9BVL2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP58Q9BVL2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP58Q9BVL2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP58Q9BVL2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP58Q9BVL2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP58Q9BVL2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP58Q9BVL2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP58Q9BVL2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP58Q9BVL2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP58Q9BVL2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP58Q9BVL2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP58Q9BVL2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP58Q9BVL2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP58Q9BVL2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP58Q9BVL2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP58Q9BVL2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP58Q9BVL2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP58Q9BVL2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP58Q9BVL2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NUP58Q9BVL2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP58Q9BVL2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP58Q9BVL2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP58Q9BVL2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP58Q9BVL2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP58Q9BVL2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP58Q9BVL2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP58Q9BVL2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP58Q9BVL2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP58Q9BVL2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP58Q9BVL2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP58Q9BVL2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP58Q9BVL2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP58Q9BVL2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP58Q9BVL2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP58Q9BVL2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP58Q9BVL2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP58Q9BVL2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP58Q9BVL2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP58Q9BVL2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP58Q9BVL2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP58Q9BVL2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP58Q9BVL2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP58Q9BVL2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP58Q9BVL2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP58Q9BVL2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP58Q9BVL2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NUP58Q9BVL2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP58Q9BVL2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP58Q9BVL2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP58Q9BVL2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP58Q9BVL2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP58Q9BVL2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP58Q9BVL2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP58Q9BVL2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP58Q9BVL2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP58Q9BVL2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP58Q9BVL2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP58Q9BVL2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP58Q9BVL2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP58Q9BVL2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP58Q9BVL2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP58Q9BVL2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP58Q9BVL2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP58Q9BVL2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP58Q9BVL2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP58Q9BVL2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP58Q9BVL2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP58Q9BVL2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUP58Q9BVL2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP58Q9BVL2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP58Q9BVL2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP58Q9BVL2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP58Q9BVL2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP58Q9BVL2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP58Q9BVL2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP58Q9BVL2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP58Q9BVL2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP58Q9BVL2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP58Q9BVL2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP58Q9BVL2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP58Q9BVL2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP58Q9BVL2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP58Q9BVL2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP58Q9BVL2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP58Q9BVL2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms