Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIKE1Q9BRV8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIKE1Q9BRV8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SIKE1Q9BRV8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIKE1Q9BRV8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIKE1Q9BRV8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIKE1Q9BRV8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIKE1Q9BRV8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIKE1Q9BRV8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIKE1Q9BRV8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIKE1Q9BRV8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIKE1Q9BRV8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIKE1Q9BRV8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIKE1Q9BRV8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIKE1Q9BRV8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIKE1Q9BRV8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIKE1Q9BRV8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIKE1Q9BRV8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIKE1Q9BRV8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SIKE1Q9BRV8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SIKE1Q9BRV8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIKE1Q9BRV8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIKE1Q9BRV8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIKE1Q9BRV8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SIKE1Q9BRV8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIKE1Q9BRV8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIKE1Q9BRV8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIKE1Q9BRV8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SIKE1Q9BRV8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIKE1Q9BRV8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIKE1Q9BRV8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIKE1Q9BRV8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIKE1Q9BRV8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIKE1Q9BRV8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SIKE1Q9BRV8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIKE1Q9BRV8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIKE1Q9BRV8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIKE1Q9BRV8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIKE1Q9BRV8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIKE1Q9BRV8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIKE1Q9BRV8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIKE1Q9BRV8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIKE1Q9BRV8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIKE1Q9BRV8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIKE1Q9BRV8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SIKE1Q9BRV8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIKE1Q9BRV8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIKE1Q9BRV8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIKE1Q9BRV8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms