Protein–RNA interactions for Protein: Q99805

TM9SF2, Transmembrane 9 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF2Q99805 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM9SF2Q99805 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM9SF2Q99805 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM9SF2Q99805 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.8 ms