Protein–RNA interactions for Protein: Q99643

SDHC, Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHCQ99643 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDHCQ99643 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDHCQ99643 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SDHCQ99643 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDHCQ99643 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDHCQ99643 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDHCQ99643 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDHCQ99643 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDHCQ99643 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SDHCQ99643 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDHCQ99643 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDHCQ99643 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDHCQ99643 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDHCQ99643 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDHCQ99643 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDHCQ99643 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDHCQ99643 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SDHCQ99643 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDHCQ99643 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDHCQ99643 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDHCQ99643 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDHCQ99643 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDHCQ99643 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SDHCQ99643 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDHCQ99643 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDHCQ99643 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDHCQ99643 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDHCQ99643 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDHCQ99643 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDHCQ99643 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDHCQ99643 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms