Protein–RNA interactions for Protein: Q96EQ0

SGTB, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTBQ96EQ0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGTBQ96EQ0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGTBQ96EQ0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGTBQ96EQ0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGTBQ96EQ0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGTBQ96EQ0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGTBQ96EQ0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGTBQ96EQ0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGTBQ96EQ0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGTBQ96EQ0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGTBQ96EQ0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGTBQ96EQ0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGTBQ96EQ0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGTBQ96EQ0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGTBQ96EQ0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGTBQ96EQ0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGTBQ96EQ0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SGTBQ96EQ0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGTBQ96EQ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGTBQ96EQ0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGTBQ96EQ0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGTBQ96EQ0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGTBQ96EQ0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGTBQ96EQ0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SGTBQ96EQ0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGTBQ96EQ0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SGTBQ96EQ0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SGTBQ96EQ0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SGTBQ96EQ0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SGTBQ96EQ0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SGTBQ96EQ0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SGTBQ96EQ0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SGTBQ96EQ0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SGTBQ96EQ0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SGTBQ96EQ0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGTBQ96EQ0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGTBQ96EQ0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGTBQ96EQ0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGTBQ96EQ0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGTBQ96EQ0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms