Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TIFAQ96CG3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TIFAQ96CG3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TIFAQ96CG3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TIFAQ96CG3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TIFAQ96CG3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TIFAQ96CG3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TIFAQ96CG3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TIFAQ96CG3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TIFAQ96CG3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TIFAQ96CG3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TIFAQ96CG3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TIFAQ96CG3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TIFAQ96CG3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TIFAQ96CG3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TIFAQ96CG3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TIFAQ96CG3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TIFAQ96CG3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TIFAQ96CG3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TIFAQ96CG3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TIFAQ96CG3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TIFAQ96CG3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TIFAQ96CG3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TIFAQ96CG3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TIFAQ96CG3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TIFAQ96CG3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TIFAQ96CG3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TIFAQ96CG3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms