Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATAD2BQ8WXI9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATAD2BQ8WXI9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATAD2BQ8WXI9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATAD2BQ8WXI9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATAD2BQ8WXI9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATAD2BQ8WXI9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATAD2BQ8WXI9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATAD2BQ8WXI9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GATAD2BQ8WXI9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATAD2BQ8WXI9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATAD2BQ8WXI9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATAD2BQ8WXI9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATAD2BQ8WXI9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATAD2BQ8WXI9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATAD2BQ8WXI9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GATAD2BQ8WXI9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATAD2BQ8WXI9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATAD2BQ8WXI9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATAD2BQ8WXI9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GATAD2BQ8WXI9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATAD2BQ8WXI9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATAD2BQ8WXI9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATAD2BQ8WXI9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATAD2BQ8WXI9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATAD2BQ8WXI9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATAD2BQ8WXI9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GATAD2BQ8WXI9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms