Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTRT1Q8TDG2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTRT1Q8TDG2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTRT1Q8TDG2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTRT1Q8TDG2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTRT1Q8TDG2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTRT1Q8TDG2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTRT1Q8TDG2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTRT1Q8TDG2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACTRT1Q8TDG2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACTRT1Q8TDG2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACTRT1Q8TDG2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACTRT1Q8TDG2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ACTRT1Q8TDG2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ACTRT1Q8TDG2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACTRT1Q8TDG2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTRT1Q8TDG2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTRT1Q8TDG2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTRT1Q8TDG2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTRT1Q8TDG2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTRT1Q8TDG2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTRT1Q8TDG2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACTRT1Q8TDG2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACTRT1Q8TDG2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACTRT1Q8TDG2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACTRT1Q8TDG2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACTRT1Q8TDG2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACTRT1Q8TDG2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACTRT1Q8TDG2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACTRT1Q8TDG2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ACTRT1Q8TDG2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ACTRT1Q8TDG2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACTRT1Q8TDG2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTRT1Q8TDG2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTRT1Q8TDG2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTRT1Q8TDG2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACTRT1Q8TDG2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACTRT1Q8TDG2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTRT1Q8TDG2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTRT1Q8TDG2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTRT1Q8TDG2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTRT1Q8TDG2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTRT1Q8TDG2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTRT1Q8TDG2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTRT1Q8TDG2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTRT1Q8TDG2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTRT1Q8TDG2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTRT1Q8TDG2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTRT1Q8TDG2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTRT1Q8TDG2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACTRT1Q8TDG2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACTRT1Q8TDG2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACTRT1Q8TDG2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACTRT1Q8TDG2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACTRT1Q8TDG2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACTRT1Q8TDG2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTRT1Q8TDG2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTRT1Q8TDG2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTRT1Q8TDG2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTRT1Q8TDG2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms