Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV9

RHOXF1, Rhox homeobox family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF1Q8NHV9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOXF1Q8NHV9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHOXF1Q8NHV9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOXF1Q8NHV9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOXF1Q8NHV9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RHOXF1Q8NHV9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOXF1Q8NHV9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOXF1Q8NHV9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOXF1Q8NHV9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOXF1Q8NHV9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOXF1Q8NHV9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOXF1Q8NHV9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOXF1Q8NHV9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOXF1Q8NHV9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOXF1Q8NHV9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOXF1Q8NHV9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOXF1Q8NHV9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOXF1Q8NHV9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOXF1Q8NHV9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOXF1Q8NHV9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOXF1Q8NHV9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOXF1Q8NHV9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOXF1Q8NHV9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOXF1Q8NHV9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOXF1Q8NHV9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOXF1Q8NHV9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOXF1Q8NHV9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOXF1Q8NHV9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOXF1Q8NHV9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOXF1Q8NHV9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms