Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BHLHE22Q8NFJ8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BHLHE22Q8NFJ8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BHLHE22Q8NFJ8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BHLHE22Q8NFJ8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BHLHE22Q8NFJ8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BHLHE22Q8NFJ8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BHLHE22Q8NFJ8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHLHE22Q8NFJ8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHLHE22Q8NFJ8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHLHE22Q8NFJ8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHLHE22Q8NFJ8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHLHE22Q8NFJ8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHLHE22Q8NFJ8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHLHE22Q8NFJ8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHLHE22Q8NFJ8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHLHE22Q8NFJ8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHLHE22Q8NFJ8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHLHE22Q8NFJ8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHLHE22Q8NFJ8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHLHE22Q8NFJ8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHLHE22Q8NFJ8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHLHE22Q8NFJ8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHLHE22Q8NFJ8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHLHE22Q8NFJ8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHLHE22Q8NFJ8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHLHE22Q8NFJ8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BHLHE22Q8NFJ8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHLHE22Q8NFJ8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BHLHE22Q8NFJ8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms