Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.773e-7■■■■■ 53.3
AGGF1Q8N302 CBFA2T3-209ENST00000569443 469 ntTSL 512.68□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 53
AGGF1Q8N302 FUT10-211ENST00000524021 2042 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.344e-8■■■■■ 52.9
AGGF1Q8N302 FUT10-209ENST00000520767 1623 ntTSL 1 (best)12.11□□□□□ -0.474e-8■■■■■ 52.9
AGGF1Q8N302 FUT10-205ENST00000518076 1221 ntTSL 412.09□□□□□ -0.474e-8■■■■■ 52.9
AGGF1Q8N302 FUT10-201ENST00000327671 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.74e-8■■■■■ 52.9
AGGF1Q8N302 FUT10-206ENST00000518672 3115 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.044e-8■■■■■ 52.9
AGGF1Q8N302 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.094e-8■■■■■ 52.8
AGGF1Q8N302 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.154e-8■■■■■ 52.8
AGGF1Q8N302 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.013e-7■■■■■ 52.5
AGGF1Q8N302 EGFR-201ENST00000275493 9821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.613e-7■■■■■ 52.5
AGGF1Q8N302 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.229e-12■■■■■ 52.5
AGGF1Q8N302 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.229e-12■■■■■ 52.5
AGGF1Q8N302 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.119e-12■■■■■ 52.5
AGGF1Q8N302 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.119e-12■■■■■ 52.5
AGGF1Q8N302 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.119e-12■■■■■ 52.5
AGGF1Q8N302 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.189e-12■■■■■ 52.5
AGGF1Q8N302 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.199e-12■■■■■ 52.5
AGGF1Q8N302 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.199e-12■■■■■ 52.5
AGGF1Q8N302 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.199e-12■■■■■ 52.5
AGGF1Q8N302 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.199e-12■■■■■ 52.5
AGGF1Q8N302 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.229e-12■■■■■ 52.5
AGGF1Q8N302 DYSF-215ENST00000475076 669 ntTSL 212.86□□□□□ -0.359e-12■■■■■ 52.5
AGGF1Q8N302 DYSF-216ENST00000479049 3399 ntTSL 510.81□□□□□ -0.689e-12■■■■■ 52.5
AGGF1Q8N302 PKP3-204ENST00000526971 532 ntTSL 218.59■□□□□ 0.579e-13■■■■■ 52
AGGF1Q8N302 CBFA2T3-211ENST00000570046 284 ntTSL 39.48□□□□□ -0.892e-7■■■■■ 52
AGGF1Q8N302 C16orf95-203ENST00000564821 487 ntTSL 37.64□□□□□ -1.195e-7■■■■■ 51.8
AGGF1Q8N302 VSNL1-202ENST00000404666 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.63e-15■■■■■ 51.8
AGGF1Q8N302 VSNL1-201ENST00000295156 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.683e-15■■■■■ 51.8
AGGF1Q8N302 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.473e-15■■■■■ 51.8
AGGF1Q8N302 ALG12-202ENST00000486602 674 ntTSL 39.2□□□□□ -0.941e-11■■■■■ 51.7
AGGF1Q8N302 ALG12-203ENST00000492791 753 ntTSL 38.53□□□□□ -1.041e-11■■■■■ 51.7
AGGF1Q8N302 UBASH3A-208ENST00000635189 567 ntTSL 412.56□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 51.5
AGGF1Q8N302 UBASH3A-207ENST00000635108 572 ntTSL 411.64□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 51.5
AGGF1Q8N302 UBASH3A-206ENST00000634718 696 ntTSL 311.38□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 51.5
AGGF1Q8N302 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 51.5
AGGF1Q8N302 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.031e-14■■■■■ 51.4
AGGF1Q8N302 NINJ2-204ENST00000537416 323 ntTSL 313.27□□□□□ -0.291e-14■■■■■ 51.4
AGGF1Q8N302 NINJ2-203ENST00000433832 945 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.871e-14■■■■■ 51.4
AGGF1Q8N302 NINJ2-205ENST00000542920 670 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.911e-14■■■■■ 51.4
AGGF1Q8N302 NINJ2-202ENST00000397265 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.071e-14■■■■■ 51.4
AGGF1Q8N302 NCOR2-222ENST00000536195 452 ntTSL 311.49□□□□□ -0.577e-11■■■■■ 51.3
AGGF1Q8N302 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.696e-38■■■■■ 51.3
AGGF1Q8N302 VAV2-204ENST00000472905 506 ntTSL 316.14■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 51.2
AGGF1Q8N302 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.085e-7■■■■■ 51.2
AGGF1Q8N302 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.095e-7■■■■■ 51.2
AGGF1Q8N302 AC009055.2-201ENST00000567058 1337 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.881e-9■■■■■ 51.1
AGGF1Q8N302 AC009055.2-202ENST00000565901 146 ntTSL 54.11□□□□□ -1.751e-9■■■■■ 51.1
AGGF1Q8N302 AACS-204ENST00000418937 1235 ntTSL 213.45□□□□□ -0.261e-8■■■■■ 50.9
AGGF1Q8N302 AACS-201ENST00000316519 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.261e-8■■■■■ 50.9
AGGF1Q8N302 RAD51B-212ENST00000488612 1550 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.117e-7■■■■■ 50.8
AGGF1Q8N302 RAD51B-207ENST00000478014 618 ntTSL 36.57□□□□□ -1.367e-7■■■■■ 50.8
AGGF1Q8N302 RAD51B-216ENST00000553595 795 ntTSL 36.43□□□□□ -1.387e-7■■■■■ 50.8
AGGF1Q8N302 RAD51B-219ENST00000554244 669 ntTSL 36.1□□□□□ -1.437e-7■■■■■ 50.8
AGGF1Q8N302 RASA1-206ENST00000515800 4979 ntTSL 1 (best)17.7■□□□□ 0.425e-10■■■■■ 50.4
AGGF1Q8N302 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.235e-10■■■■■ 50.4
AGGF1Q8N302 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.585e-10■■■■■ 50.4
AGGF1Q8N302 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.645e-10■■■■■ 50.4
AGGF1Q8N302 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.875e-10■■■■■ 50.4
AGGF1Q8N302 BRMS1-207ENST00000530238 1817 ntTSL 524.26■■□□□ 1.472e-7■■■■■ 50.3
AGGF1Q8N302 BRMS1-205ENST00000527375 913 ntTSL 315.07■□□□□ 02e-7■■■■■ 50.3
AGGF1Q8N302 BRMS1-204ENST00000525127 750 ntTSL 214.63□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 50.3
AGGF1Q8N302 BRMS1-203ENST00000524699 1131 ntTSL 314.39□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 50.3
AGGF1Q8N302 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 50.3
AGGF1Q8N302 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 50.3
AGGF1Q8N302 BRMS1-208ENST00000530756 963 ntTSL 1 (best)13.71□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 50.3
AGGF1Q8N302 BRMS1-209ENST00000534617 905 ntTSL 213.54□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 50.3
AGGF1Q8N302 POLA2-202ENST00000525924 873 ntTSL 58.8□□□□□ -16e-8■■■■■ 50.3
AGGF1Q8N302 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.771e-8■■■■■ 50.2
AGGF1Q8N302 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.541e-8■■■■■ 50.2
AGGF1Q8N302 RPH3AL-205ENST00000570893 594 ntTSL 316.11■□□□□ 0.171e-8■■■■■ 50.2
AGGF1Q8N302 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.161e-8■■■■■ 50.2
AGGF1Q8N302 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.121e-8■■■■■ 50.2
AGGF1Q8N302 RPH3AL-219ENST00000576001 647 ntTSL 315.03■□□□□ -01e-8■■■■■ 50.2
AGGF1Q8N302 RPH3AL-206ENST00000570954 568 ntTSL 412.15□□□□□ -0.461e-8■■■■■ 50.2
AGGF1Q8N302 TRRAP-205ENST00000456197 11654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)8.33□□□□□ -1.083e-8■■■■■ 49.9
AGGF1Q8N302 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.183e-8■■■■■ 49.9
AGGF1Q8N302 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.193e-8■■■■■ 49.9
AGGF1Q8N302 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.193e-8■■■■■ 49.9
AGGF1Q8N302 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.43e-8■■■■■ 49.9
AGGF1Q8N302 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.15e-7■■■■■ 49.8
AGGF1Q8N302 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.95e-7■■■■■ 49.8
AGGF1Q8N302 HSD17B14-202ENST00000595764 674 ntTSL 518.49■□□□□ 0.555e-7■■■■■ 49.8
AGGF1Q8N302 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.042e-7■■■■■ 49.7
AGGF1Q8N302 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.972e-7■■■■■ 49.7
AGGF1Q8N302 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.942e-7■■■■■ 49.7
AGGF1Q8N302 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.82e-7■■■■■ 49.7
AGGF1Q8N302 TPCN2-206ENST00000635811 3824 ntTSL 515.48■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 49.7
AGGF1Q8N302 TPCN2-207ENST00000637084 4622 ntTSL 1 (best)14.88□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 49.7
AGGF1Q8N302 TPCN2-202ENST00000442692 4376 ntTSL 212.2□□□□□ -0.462e-7■■■■■ 49.7
AGGF1Q8N302 TECPR2-201ENST00000359520 8686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.591e-11■■■■■ 49.6
AGGF1Q8N302 UBLCP1-201ENST00000296786 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.861e-11■■■■■ 49.5
AGGF1Q8N302 UBLCP1-202ENST00000519276 1558 ntTSL 59.53□□□□□ -0.881e-11■■■■■ 49.5
AGGF1Q8N302 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.285e-7■■■■■ 49.2
AGGF1Q8N302 DIP2C-201ENST00000280886 7888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.685e-7■■■■■ 49.2
AGGF1Q8N302 DIP2C-202ENST00000381496 7749 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.75e-7■■■■■ 49.2
AGGF1Q8N302 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.351e-6■■■■■ 49.1
AGGF1Q8N302 SAMM50-203ENST00000474323 2368 ntTSL 215.63■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 49.1
AGGF1Q8N302 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.092e-11■■■■■ 49
AGGF1Q8N302 DMAC2-211ENST00000594339 782 ntTSL 211.93□□□□□ -0.52e-11■■■■■ 49
Retrieved 100 of 9,853 protein–RNA pairs in 323.6 ms