RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527375.5

BRMS1-205, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 3

Gene BRMS1, Length 913 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-205ENST00000527375 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.82■■■■□ 3.48
BRMS1-205ENST00000527375 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.81■■■□□ 2.84
BRMS1-205ENST00000527375 ABCC9O60706 1549 aa31.8■■■□□ 2.68
BRMS1-205ENST00000527375 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.75■■■□□ 2.51
BRMS1-205ENST00000527375 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.74■■■□□ 2.51
BRMS1-205ENST00000527375 NACADO15069 1562 aa30.72■■■□□ 2.51
BRMS1-205ENST00000527375 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.5
BRMS1-205ENST00000527375 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.52■■■□□ 2.48
BRMS1-205ENST00000527375 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.47■■■□□ 2.47
BRMS1-205ENST00000527375 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.21■■■□□ 2.43
BRMS1-205ENST00000527375 SCRIBQ14160 1630 aa29.9■■■□□ 2.38
BRMS1-205ENST00000527375 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.73■■■□□ 2.35
BRMS1-205ENST00000527375 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.68■■■□□ 2.34
BRMS1-205ENST00000527375 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.43■■■□□ 2.3
BRMS1-205ENST00000527375 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
BRMS1-205ENST00000527375 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.88■■■□□ 2.21
BRMS1-205ENST00000527375 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.83■■■□□ 2.21
BRMS1-205ENST00000527375 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.62■■■□□ 2.17
BRMS1-205ENST00000527375 SMARCA4P51532 1647 aa28.61■■■□□ 2.17
BRMS1-205ENST00000527375 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
BRMS1-205ENST00000527375 SMARCA2P51531 1590 aa28.37■■■□□ 2.13
BRMS1-205ENST00000527375 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.37■■■□□ 2.13
BRMS1-205ENST00000527375 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.3■■■□□ 2.12
BRMS1-205ENST00000527375 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.27■■■□□ 2.12
BRMS1-205ENST00000527375 NCAPD3P42695 1498 aa28.24■■■□□ 2.11
BRMS1-205ENST00000527375 HMGXB3Q12766 1538 aa28.2■■■□□ 2.1
BRMS1-205ENST00000527375 WIZO95785 1651 aa28.18■■■□□ 2.1
BRMS1-205ENST00000527375 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
BRMS1-205ENST00000527375 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
BRMS1-205ENST00000527375 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
BRMS1-205ENST00000527375 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.59■■■□□ 2.01
BRMS1-205ENST00000527375 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
BRMS1-205ENST00000527375 NESP48681 1621 aa27.55■■■□□ 2
BRMS1-205ENST00000527375 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.45■■□□□ 1.99
BRMS1-205ENST00000527375 ERCC6Q03468 1493 aa27.45■■□□□ 1.99
BRMS1-205ENST00000527375 PRDM2Q13029 1718 aa27.45■■□□□ 1.99
BRMS1-205ENST00000527375 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.44■■□□□ 1.98
BRMS1-205ENST00000527375 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.4■■□□□ 1.98
BRMS1-205ENST00000527375 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.34■■□□□ 1.97
BRMS1-205ENST00000527375 CFTRP13569 1480 aa27.32■■□□□ 1.96
BRMS1-205ENST00000527375 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.17■■□□□ 1.94
BRMS1-205ENST00000527375 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.16■■□□□ 1.94
BRMS1-205ENST00000527375 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
BRMS1-205ENST00000527375 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.06■■□□□ 1.92
BRMS1-205ENST00000527375 CUX2O14529 1486 aa27.05■■□□□ 1.92
BRMS1-205ENST00000527375 WDR62O43379 1518 aa26.95■■□□□ 1.91
BRMS1-205ENST00000527375 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
BRMS1-205ENST00000527375 ABCC8Q09428 1581 aa26.82■■□□□ 1.88
BRMS1-205ENST00000527375 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.8■■□□□ 1.88
BRMS1-205ENST00000527375 TOPBP1Q92547 1522 aa26.77■■□□□ 1.88
BRMS1-205ENST00000527375 CUX1P39880 1505 aa26.62■■□□□ 1.85
BRMS1-205ENST00000527375 IFT140Q96RY7 1462 aa26.55■■□□□ 1.84
BRMS1-205ENST00000527375 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.54■■□□□ 1.84
BRMS1-205ENST00000527375 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
BRMS1-205ENST00000527375 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.84
BRMS1-205ENST00000527375 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.52■■□□□ 1.84
BRMS1-205ENST00000527375 TOP2BQ02880 1626 aa26.5■■□□□ 1.83
BRMS1-205ENST00000527375 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
BRMS1-205ENST00000527375 SYNJ1O43426 1573 aa26.47■■□□□ 1.83
BRMS1-205ENST00000527375 SOGA1O94964 1423 aa26.43■■□□□ 1.82
BRMS1-205ENST00000527375 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.4■■□□□ 1.82
BRMS1-205ENST00000527375 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
BRMS1-205ENST00000527375 WDR97A6NE52 1622 aa26.39■■□□□ 1.81
BRMS1-205ENST00000527375 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
BRMS1-205ENST00000527375 PBRM1Q86U86 1689 aa26.25■■□□□ 1.79
BRMS1-205ENST00000527375 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.25■■□□□ 1.791e-6■■■■□ 24.7
BRMS1-205ENST00000527375 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.24■■□□□ 1.79
BRMS1-205ENST00000527375 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
BRMS1-205ENST00000527375 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.19■■□□□ 1.78
BRMS1-205ENST00000527375 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.15■■□□□ 1.78
BRMS1-205ENST00000527375 CHD1O14646 1710 aa26.14■■□□□ 1.77
BRMS1-205ENST00000527375 GRIN2BQ13224 1484 aa26.11■■□□□ 1.77
BRMS1-205ENST00000527375 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.05■■□□□ 1.76
BRMS1-205ENST00000527375 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
BRMS1-205ENST00000527375 TRIM41Q8WV44 630 aa26.04■■□□□ 1.76
BRMS1-205ENST00000527375 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.98■■□□□ 1.75
BRMS1-205ENST00000527375 FBLN2P98095 1184 aa25.97■■□□□ 1.75
BRMS1-205ENST00000527375 KIF27Q86VH2 1401 aa25.97■■□□□ 1.75
BRMS1-205ENST00000527375 OSCARQ8IYS5 282 aa25.94■■□□□ 1.74
BRMS1-205ENST00000527375 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.93■■□□□ 1.74
BRMS1-205ENST00000527375 SYNJ2O15056 1496 aa25.92■■□□□ 1.74
BRMS1-205ENST00000527375 ADAMTS12P58397 1594 aa25.92■■□□□ 1.74
BRMS1-205ENST00000527375 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
BRMS1-205ENST00000527375 CUL7Q14999 1698 aa25.87■■□□□ 1.73
BRMS1-205ENST00000527375 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.83■■□□□ 1.73
BRMS1-205ENST00000527375 GRIN2AQ12879 1464 aa25.78■■□□□ 1.72
BRMS1-205ENST00000527375 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.77■■□□□ 1.72
BRMS1-205ENST00000527375 IGF1RP08069 1367 aa25.75■■□□□ 1.71
BRMS1-205ENST00000527375 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.73■■□□□ 1.71
BRMS1-205ENST00000527375 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.68■■□□□ 1.7
BRMS1-205ENST00000527375 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.67■■□□□ 1.7
BRMS1-205ENST00000527375 CEP170Q5SW79 1584 aa25.66■■□□□ 1.7
BRMS1-205ENST00000527375 NUP160Q12769 1436 aa25.61■■□□□ 1.69
BRMS1-205ENST00000527375 EEA1Q15075 1411 aa25.6■■□□□ 1.69
BRMS1-205ENST00000527375 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.59■■□□□ 1.69
BRMS1-205ENST00000527375 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.59■■□□□ 1.69
BRMS1-205ENST00000527375 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.59■■□□□ 1.69
BRMS1-205ENST00000527375 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.56■■□□□ 1.68
BRMS1-205ENST00000527375 ARHGEF11O15085 1522 aa25.53■■□□□ 1.68
BRMS1-205ENST00000527375 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.52■■□□□ 1.68
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