RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525127.1

BRMS1-204, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 2

Gene BRMS1, Length 750 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-204ENST00000525127 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.64■■■■□ 3.3
BRMS1-204ENST00000525127 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.84■■■□□ 2.69
BRMS1-204ENST00000525127 ABCC9O60706 1549 aa31.58■■■□□ 2.65
BRMS1-204ENST00000525127 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.22■■■□□ 2.43
BRMS1-204ENST00000525127 NACADO15069 1562 aa30.08■■■□□ 2.41
BRMS1-204ENST00000525127 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.06■■■□□ 2.4
BRMS1-204ENST00000525127 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.77■■■□□ 2.36
BRMS1-204ENST00000525127 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
BRMS1-204ENST00000525127 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.48■■■□□ 2.31
BRMS1-204ENST00000525127 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.47■■■□□ 2.31
BRMS1-204ENST00000525127 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.37■■■□□ 2.29
BRMS1-204ENST00000525127 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.31■■■□□ 2.28
BRMS1-204ENST00000525127 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.22■■■□□ 2.27
BRMS1-204ENST00000525127 SCRIBQ14160 1630 aa29.02■■■□□ 2.24
BRMS1-204ENST00000525127 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29■■■□□ 2.23
BRMS1-204ENST00000525127 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
BRMS1-204ENST00000525127 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.51■■■□□ 2.15
BRMS1-204ENST00000525127 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.45■■■□□ 2.14
BRMS1-204ENST00000525127 NCAPD3P42695 1498 aa27.76■■■□□ 2.04
BRMS1-204ENST00000525127 SMARCA4P51532 1647 aa27.72■■■□□ 2.03
BRMS1-204ENST00000525127 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.7■■■□□ 2.03
BRMS1-204ENST00000525127 SMARCA2P51531 1590 aa27.68■■■□□ 2.02
BRMS1-204ENST00000525127 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
BRMS1-204ENST00000525127 HMGXB3Q12766 1538 aa27.57■■■□□ 2
BRMS1-204ENST00000525127 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
BRMS1-204ENST00000525127 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.46■■□□□ 1.99
BRMS1-204ENST00000525127 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.43■■□□□ 1.98
BRMS1-204ENST00000525127 ERCC6Q03468 1493 aa27.32■■□□□ 1.96
BRMS1-204ENST00000525127 NESP48681 1621 aa27.17■■□□□ 1.94
BRMS1-204ENST00000525127 CUX2O14529 1486 aa27.15■■□□□ 1.94
BRMS1-204ENST00000525127 WIZO95785 1651 aa27.1■■□□□ 1.93
BRMS1-204ENST00000525127 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.09■■□□□ 1.93
BRMS1-204ENST00000525127 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
BRMS1-204ENST00000525127 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.99■■□□□ 1.91
BRMS1-204ENST00000525127 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.97■■□□□ 1.91
BRMS1-204ENST00000525127 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
BRMS1-204ENST00000525127 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
BRMS1-204ENST00000525127 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.8■■□□□ 1.88
BRMS1-204ENST00000525127 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.79■■□□□ 1.88
BRMS1-204ENST00000525127 CFTRP13569 1480 aa26.68■■□□□ 1.86
BRMS1-204ENST00000525127 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.68■■□□□ 1.86
BRMS1-204ENST00000525127 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.65■■□□□ 1.86
BRMS1-204ENST00000525127 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.63■■□□□ 1.85
BRMS1-204ENST00000525127 WDR62O43379 1518 aa26.57■■□□□ 1.84
BRMS1-204ENST00000525127 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.53■■□□□ 1.84
BRMS1-204ENST00000525127 PRDM2Q13029 1718 aa26.36■■□□□ 1.81
BRMS1-204ENST00000525127 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
BRMS1-204ENST00000525127 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
BRMS1-204ENST00000525127 ABCC8Q09428 1581 aa26.18■■□□□ 1.78
BRMS1-204ENST00000525127 TOPBP1Q92547 1522 aa26.14■■□□□ 1.77
BRMS1-204ENST00000525127 IFT140Q96RY7 1462 aa26.11■■□□□ 1.77
BRMS1-204ENST00000525127 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.07■■□□□ 1.76
BRMS1-204ENST00000525127 OSCARQ8IYS5 282 aa26.01■■□□□ 1.75
BRMS1-204ENST00000525127 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
BRMS1-204ENST00000525127 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
BRMS1-204ENST00000525127 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
BRMS1-204ENST00000525127 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
BRMS1-204ENST00000525127 SOGA1O94964 1423 aa25.83■■□□□ 1.73
BRMS1-204ENST00000525127 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.81■■□□□ 1.72
BRMS1-204ENST00000525127 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.78■■□□□ 1.72
BRMS1-204ENST00000525127 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.77■■□□□ 1.72
BRMS1-204ENST00000525127 CUX1P39880 1505 aa25.77■■□□□ 1.72
BRMS1-204ENST00000525127 TRIM41Q8WV44 630 aa25.76■■□□□ 1.71
BRMS1-204ENST00000525127 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
BRMS1-204ENST00000525127 WDR97A6NE52 1622 aa25.68■■□□□ 1.7
BRMS1-204ENST00000525127 FBLN2P98095 1184 aa25.67■■□□□ 1.7
BRMS1-204ENST00000525127 GRIN2BQ13224 1484 aa25.57■■□□□ 1.68
BRMS1-204ENST00000525127 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.56■■□□□ 1.68
BRMS1-204ENST00000525127 CHD1O14646 1710 aa25.56■■□□□ 1.68
BRMS1-204ENST00000525127 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
BRMS1-204ENST00000525127 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
BRMS1-204ENST00000525127 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.53■■□□□ 1.68
BRMS1-204ENST00000525127 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.52■■□□□ 1.68
BRMS1-204ENST00000525127 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.51■■□□□ 1.67
BRMS1-204ENST00000525127 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.51■■□□□ 1.67
BRMS1-204ENST00000525127 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.51■■□□□ 1.67
BRMS1-204ENST00000525127 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.51■■□□□ 1.67
BRMS1-204ENST00000525127 ARHGEF11O15085 1522 aa25.49■■□□□ 1.67
BRMS1-204ENST00000525127 TOP2BQ02880 1626 aa25.45■■□□□ 1.67
BRMS1-204ENST00000525127 SYNJ2O15056 1496 aa25.44■■□□□ 1.66
BRMS1-204ENST00000525127 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.42■■□□□ 1.66
BRMS1-204ENST00000525127 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.4■■□□□ 1.66
BRMS1-204ENST00000525127 SYNJ1O43426 1573 aa25.39■■□□□ 1.66
BRMS1-204ENST00000525127 PBRM1Q86U86 1689 aa25.39■■□□□ 1.65
BRMS1-204ENST00000525127 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.35■■□□□ 1.65
BRMS1-204ENST00000525127 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.31■■□□□ 1.64
BRMS1-204ENST00000525127 ARAP1Q96P48 1450 aa25.25■■□□□ 1.63
BRMS1-204ENST00000525127 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.21■■□□□ 1.63
BRMS1-204ENST00000525127 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.21■■□□□ 1.63
BRMS1-204ENST00000525127 GRIN2AQ12879 1464 aa25.21■■□□□ 1.63
BRMS1-204ENST00000525127 ADAMTS12P58397 1594 aa25.2■■□□□ 1.62
BRMS1-204ENST00000525127 NUP160Q12769 1436 aa25.11■■□□□ 1.61
BRMS1-204ENST00000525127 CEP170Q5SW79 1584 aa25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-204ENST00000525127 KIF27Q86VH2 1401 aa25.04■■□□□ 1.6
BRMS1-204ENST00000525127 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
BRMS1-204ENST00000525127 IGF1RP08069 1367 aa24.96■■□□□ 1.59
BRMS1-204ENST00000525127 SHROOM2Q13796 1616 aa24.92■■□□□ 1.58
BRMS1-204ENST00000525127 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.91■■□□□ 1.58
BRMS1-204ENST00000525127 JPH4Q96JJ6 628 aa24.91■■□□□ 1.58
BRMS1-204ENST00000525127 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.89■■□□□ 1.58
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