RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534617.5

BRMS1-209, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 2

Gene BRMS1, Length 905 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-209ENST00000534617 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.56■■■■□ 3.12
BRMS1-209ENST00000534617 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.89■■■□□ 2.54
BRMS1-209ENST00000534617 ABCC9O60706 1549 aa30.47■■■□□ 2.47
BRMS1-209ENST00000534617 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.18■■■□□ 2.26
BRMS1-209ENST00000534617 NACADO15069 1562 aa29.06■■■□□ 2.24
BRMS1-209ENST00000534617 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.98■■■□□ 2.23
BRMS1-209ENST00000534617 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.76■■■□□ 2.19
BRMS1-209ENST00000534617 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
BRMS1-209ENST00000534617 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.56■■■□□ 2.16
BRMS1-209ENST00000534617 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.55■■■□□ 2.16
BRMS1-209ENST00000534617 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.39■■■□□ 2.14
BRMS1-209ENST00000534617 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.3■■■□□ 2.12
BRMS1-209ENST00000534617 SCRIBQ14160 1630 aa28.2■■■□□ 2.1
BRMS1-209ENST00000534617 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.12■■■□□ 2.09
BRMS1-209ENST00000534617 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.96■■■□□ 2.07
BRMS1-209ENST00000534617 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
BRMS1-209ENST00000534617 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.55■■■□□ 2
BRMS1-209ENST00000534617 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.39■■□□□ 1.98
BRMS1-209ENST00000534617 SMARCA4P51532 1647 aa26.91■■□□□ 1.9
BRMS1-209ENST00000534617 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
BRMS1-209ENST00000534617 NCAPD3P42695 1498 aa26.79■■□□□ 1.88
BRMS1-209ENST00000534617 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.79■■□□□ 1.88
BRMS1-209ENST00000534617 SMARCA2P51531 1590 aa26.77■■□□□ 1.88
BRMS1-209ENST00000534617 HMGXB3Q12766 1538 aa26.69■■□□□ 1.86
BRMS1-209ENST00000534617 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.65■■□□□ 1.86
BRMS1-209ENST00000534617 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.61■■□□□ 1.85
BRMS1-209ENST00000534617 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
BRMS1-209ENST00000534617 WIZO95785 1651 aa26.38■■□□□ 1.81
BRMS1-209ENST00000534617 ERCC6Q03468 1493 aa26.3■■□□□ 1.8
BRMS1-209ENST00000534617 NESP48681 1621 aa26.28■■□□□ 1.8
BRMS1-209ENST00000534617 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
BRMS1-209ENST00000534617 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.17■■□□□ 1.78
BRMS1-209ENST00000534617 CUX2O14529 1486 aa26.08■■□□□ 1.77
BRMS1-209ENST00000534617 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
BRMS1-209ENST00000534617 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.01■■□□□ 1.75
BRMS1-209ENST00000534617 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.99■■□□□ 1.75
BRMS1-209ENST00000534617 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
BRMS1-209ENST00000534617 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.97■■□□□ 1.75
BRMS1-209ENST00000534617 CFTRP13569 1480 aa25.8■■□□□ 1.72
BRMS1-209ENST00000534617 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.77■■□□□ 1.72
BRMS1-209ENST00000534617 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.76■■□□□ 1.71
BRMS1-209ENST00000534617 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.74■■□□□ 1.71
BRMS1-209ENST00000534617 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.72■■□□□ 1.71
BRMS1-209ENST00000534617 WDR62O43379 1518 aa25.69■■□□□ 1.7
BRMS1-209ENST00000534617 PRDM2Q13029 1718 aa25.67■■□□□ 1.7
BRMS1-209ENST00000534617 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.51■■□□□ 1.67
BRMS1-209ENST00000534617 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
BRMS1-209ENST00000534617 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
BRMS1-209ENST00000534617 TOPBP1Q92547 1522 aa25.3■■□□□ 1.64
BRMS1-209ENST00000534617 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.27■■□□□ 1.64
BRMS1-209ENST00000534617 ABCC8Q09428 1581 aa25.25■■□□□ 1.63
BRMS1-209ENST00000534617 IFT140Q96RY7 1462 aa25.2■■□□□ 1.62
BRMS1-209ENST00000534617 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
BRMS1-209ENST00000534617 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
BRMS1-209ENST00000534617 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
BRMS1-209ENST00000534617 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-209ENST00000534617 CUX1P39880 1505 aa25.02■■□□□ 1.6
BRMS1-209ENST00000534617 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.99■■□□□ 1.59
BRMS1-209ENST00000534617 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.96■■□□□ 1.59
BRMS1-209ENST00000534617 SOGA1O94964 1423 aa24.94■■□□□ 1.58
BRMS1-209ENST00000534617 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.58
BRMS1-209ENST00000534617 OSCARQ8IYS5 282 aa24.89■■□□□ 1.58
BRMS1-209ENST00000534617 WDR97A6NE52 1622 aa24.83■■□□□ 1.57
BRMS1-209ENST00000534617 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
BRMS1-209ENST00000534617 CHD1O14646 1710 aa24.8■■□□□ 1.56
BRMS1-209ENST00000534617 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.75■■□□□ 1.55
BRMS1-209ENST00000534617 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.55
BRMS1-209ENST00000534617 SYNJ1O43426 1573 aa24.74■■□□□ 1.55
BRMS1-209ENST00000534617 TOP2BQ02880 1626 aa24.74■■□□□ 1.55
BRMS1-209ENST00000534617 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.73■■□□□ 1.55
BRMS1-209ENST00000534617 PBRM1Q86U86 1689 aa24.7■■□□□ 1.54
BRMS1-209ENST00000534617 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.7■■□□□ 1.54
BRMS1-209ENST00000534617 GRIN2BQ13224 1484 aa24.7■■□□□ 1.54
BRMS1-209ENST00000534617 FBLN2P98095 1184 aa24.69■■□□□ 1.54
BRMS1-209ENST00000534617 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.67■■□□□ 1.54
BRMS1-209ENST00000534617 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.66■■□□□ 1.54
BRMS1-209ENST00000534617 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
BRMS1-209ENST00000534617 TRIM41Q8WV44 630 aa24.66■■□□□ 1.54
BRMS1-209ENST00000534617 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.62■■□□□ 1.53
BRMS1-209ENST00000534617 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.62■■□□□ 1.53
BRMS1-209ENST00000534617 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.62■■□□□ 1.53
BRMS1-209ENST00000534617 SYNJ2O15056 1496 aa24.58■■□□□ 1.52
BRMS1-209ENST00000534617 ARHGEF11O15085 1522 aa24.57■■□□□ 1.52
BRMS1-209ENST00000534617 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
BRMS1-209ENST00000534617 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.48■■□□□ 1.51
BRMS1-209ENST00000534617 ADAMTS12P58397 1594 aa24.47■■□□□ 1.51
BRMS1-209ENST00000534617 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.41■■□□□ 1.5
BRMS1-209ENST00000534617 GRIN2AQ12879 1464 aa24.39■■□□□ 1.5
BRMS1-209ENST00000534617 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.35■■□□□ 1.49
BRMS1-209ENST00000534617 ARAP1Q96P48 1450 aa24.35■■□□□ 1.49
BRMS1-209ENST00000534617 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.31■■□□□ 1.48
BRMS1-209ENST00000534617 CEP170Q5SW79 1584 aa24.3■■□□□ 1.48
BRMS1-209ENST00000534617 NUP160Q12769 1436 aa24.27■■□□□ 1.48
BRMS1-209ENST00000534617 KIF27Q86VH2 1401 aa24.25■■□□□ 1.47
BRMS1-209ENST00000534617 CUL7Q14999 1698 aa24.18■■□□□ 1.46
BRMS1-209ENST00000534617 SHROOM2Q13796 1616 aa24.14■■□□□ 1.46
BRMS1-209ENST00000534617 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.14■■□□□ 1.45
BRMS1-209ENST00000534617 IGF1RP08069 1367 aa24.13■■□□□ 1.45
BRMS1-209ENST00000534617 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.12■■□□□ 1.45
BRMS1-209ENST00000534617 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.01■■□□□ 1.43
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