RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530238.5

BRMS1-207, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 5

Gene BRMS1, Length 1,817 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-207ENST00000530238 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.79■■■■■ 5.56
BRMS1-207ENST00000530238 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.03■■■■■ 4.64
BRMS1-207ENST00000530238 ABCC9O60706 1549 aa43.07■■■■■ 4.48
BRMS1-207ENST00000530238 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.67■■■■■ 4.26
BRMS1-207ENST00000530238 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
BRMS1-207ENST00000530238 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.35■■■■■ 4.21
BRMS1-207ENST00000530238 NACADO15069 1562 aa41.35■■■■■ 4.21
BRMS1-207ENST00000530238 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.1■■■■■ 4.17
BRMS1-207ENST00000530238 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.08■■■■■ 4.17
BRMS1-207ENST00000530238 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.56■■■■■ 4.08
BRMS1-207ENST00000530238 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.49■■■■■ 4.07
BRMS1-207ENST00000530238 SCRIBQ14160 1630 aa40.41■■■■■ 4.06
BRMS1-207ENST00000530238 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.35■■■■■ 4.05
BRMS1-207ENST00000530238 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.22■■■■■ 4.03
BRMS1-207ENST00000530238 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
BRMS1-207ENST00000530238 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.37■■■■□ 3.89
BRMS1-207ENST00000530238 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.1■■■■□ 3.85
BRMS1-207ENST00000530238 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.9■■■■□ 3.82
BRMS1-207ENST00000530238 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.89■■■■□ 3.82
BRMS1-207ENST00000530238 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.88■■■■□ 3.81
BRMS1-207ENST00000530238 SMARCA4P51532 1647 aa38.59■■■■□ 3.77
BRMS1-207ENST00000530238 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.53■■■■□ 3.76
BRMS1-207ENST00000530238 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.47■■■■□ 3.75
BRMS1-207ENST00000530238 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.35■■■■□ 3.73
BRMS1-207ENST00000530238 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.32■■■■□ 3.72
BRMS1-207ENST00000530238 SMARCA2P51531 1590 aa38.19■■■■□ 3.7
BRMS1-207ENST00000530238 NCAPD3P42695 1498 aa38.19■■■■□ 3.7
BRMS1-207ENST00000530238 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.13■■■■□ 3.69
BRMS1-207ENST00000530238 WIZO95785 1651 aa38.09■■■■□ 3.69
BRMS1-207ENST00000530238 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38■■■■□ 3.67
BRMS1-207ENST00000530238 HMGXB3Q12766 1538 aa38■■■■□ 3.67
BRMS1-207ENST00000530238 HRCP23327 699 aa37.66■■■■□ 3.62
BRMS1-207ENST00000530238 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.58■■■■□ 3.61
BRMS1-207ENST00000530238 PCGF6Q9BYE7 350 aa37.4■■■■□ 3.58
BRMS1-207ENST00000530238 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.39■■■■□ 3.58
BRMS1-207ENST00000530238 NESP48681 1621 aa37.38■■■■□ 3.58
BRMS1-207ENST00000530238 TRIM41Q8WV44 630 aa37.31■■■■□ 3.56
BRMS1-207ENST00000530238 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.21■■■■□ 3.55
BRMS1-207ENST00000530238 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.13■■■■□ 3.53
BRMS1-207ENST00000530238 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.12■■■■□ 3.53
BRMS1-207ENST00000530238 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP37.08■■■■□ 3.53
BRMS1-207ENST00000530238 ERCC6Q03468 1493 aa37.01■■■■□ 3.51
BRMS1-207ENST00000530238 CFTRP13569 1480 aa36.96■■■■□ 3.51
BRMS1-207ENST00000530238 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.89■■■■□ 3.5
BRMS1-207ENST00000530238 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.86■■■■□ 3.49
BRMS1-207ENST00000530238 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.74■■■■□ 3.47
BRMS1-207ENST00000530238 PRDM2Q13029 1718 aa36.66■■■■□ 3.46
BRMS1-207ENST00000530238 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
BRMS1-207ENST00000530238 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.63■■■■□ 3.45
BRMS1-207ENST00000530238 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
BRMS1-207ENST00000530238 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
BRMS1-207ENST00000530238 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.51■■■■□ 3.44
BRMS1-207ENST00000530238 CUX2O14529 1486 aa36.41■■■■□ 3.42
BRMS1-207ENST00000530238 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
BRMS1-207ENST00000530238 WDR62O43379 1518 aa36.38■■■■□ 3.41
BRMS1-207ENST00000530238 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
BRMS1-207ENST00000530238 ABCC8Q09428 1581 aa36.27■■■■□ 3.4
BRMS1-207ENST00000530238 EEA1Q15075 1411 aa36.26■■■■□ 3.4
BRMS1-207ENST00000530238 TOPBP1Q92547 1522 aa36.18■■■■□ 3.38
BRMS1-207ENST00000530238 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.11■■■■□ 3.37
BRMS1-207ENST00000530238 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.07■■■■□ 3.37
BRMS1-207ENST00000530238 CUX1P39880 1505 aa36.06■■■■□ 3.36
BRMS1-207ENST00000530238 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.98■■■■□ 3.35
BRMS1-207ENST00000530238 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.95■■■■□ 3.35
BRMS1-207ENST00000530238 SYNJ1O43426 1573 aa35.95■■■■□ 3.35
BRMS1-207ENST00000530238 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
BRMS1-207ENST00000530238 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.87■■■■□ 3.33
BRMS1-207ENST00000530238 SOGA1O94964 1423 aa35.86■■■■□ 3.33
BRMS1-207ENST00000530238 CEP162Q5TB80 1403 aa35.86■■■■□ 3.33
BRMS1-207ENST00000530238 TOP2BQ02880 1626 aa35.84■■■■□ 3.33
BRMS1-207ENST00000530238 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.83■■■■□ 3.33
BRMS1-207ENST00000530238 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.82■■■■□ 3.32
BRMS1-207ENST00000530238 IFT140Q96RY7 1462 aa35.81■■■■□ 3.32
BRMS1-207ENST00000530238 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.8■■■■□ 3.32
BRMS1-207ENST00000530238 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
BRMS1-207ENST00000530238 GOLGA3Q08378 1498 aa35.79■■■■□ 3.32
BRMS1-207ENST00000530238 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
BRMS1-207ENST00000530238 KIF21BO75037 1637 aa35.68■■■■□ 3.3
BRMS1-207ENST00000530238 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.62■■■■□ 3.291e-6■■■■□ 24.7
BRMS1-207ENST00000530238 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.6■■■■□ 3.29
BRMS1-207ENST00000530238 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
BRMS1-207ENST00000530238 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
BRMS1-207ENST00000530238 WDR97A6NE52 1622 aa35.52■■■■□ 3.28
BRMS1-207ENST00000530238 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
BRMS1-207ENST00000530238 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.47■■■■□ 3.27
BRMS1-207ENST00000530238 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
BRMS1-207ENST00000530238 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.33■■■■□ 3.25
BRMS1-207ENST00000530238 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.33■■■■□ 3.25
BRMS1-207ENST00000530238 GRIN2BQ13224 1484 aa35.25■■■■□ 3.23
BRMS1-207ENST00000530238 PBRM1Q86U86 1689 aa35.25■■■■□ 3.23
BRMS1-207ENST00000530238 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.24■■■■□ 3.23
BRMS1-207ENST00000530238 CLIP1P30622 1438 aa35.23■■■■□ 3.23
BRMS1-207ENST00000530238 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
BRMS1-207ENST00000530238 KIF27Q86VH2 1401 aa35.17■■■■□ 3.22
BRMS1-207ENST00000530238 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.17■■■■□ 3.22
BRMS1-207ENST00000530238 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.16■■■■□ 3.22
BRMS1-207ENST00000530238 FBLN2P98095 1184 aa35.16■■■■□ 3.22
BRMS1-207ENST00000530238 CHD1O14646 1710 aa35.11■■■■□ 3.21
BRMS1-207ENST00000530238 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
BRMS1-207ENST00000530238 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.09■■■■□ 3.21
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