RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530756.1

BRMS1-208, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene BRMS1, Length 963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-208ENST00000530756 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.28■■■■□ 3.56
BRMS1-208ENST00000530756 ABCC9O60706 1549 aa33.84■■■■□ 3.01
BRMS1-208ENST00000530756 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.47■■■□□ 2.95
BRMS1-208ENST00000530756 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.07■■■□□ 2.72
BRMS1-208ENST00000530756 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.98■■■□□ 2.71
BRMS1-208ENST00000530756 NACADO15069 1562 aa31.69■■■□□ 2.66
BRMS1-208ENST00000530756 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.55■■■□□ 2.64
BRMS1-208ENST00000530756 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.49■■■□□ 2.63
BRMS1-208ENST00000530756 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.38■■■□□ 2.61
BRMS1-208ENST00000530756 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.22■■■□□ 2.59
BRMS1-208ENST00000530756 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.15■■■□□ 2.58
BRMS1-208ENST00000530756 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
BRMS1-208ENST00000530756 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.7■■■□□ 2.51
BRMS1-208ENST00000530756 SCRIBQ14160 1630 aa30.6■■■□□ 2.49
BRMS1-208ENST00000530756 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.54■■■□□ 2.48
BRMS1-208ENST00000530756 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.52■■■□□ 2.48
BRMS1-208ENST00000530756 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.45■■■□□ 2.47
BRMS1-208ENST00000530756 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
BRMS1-208ENST00000530756 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.46■■■□□ 2.31
BRMS1-208ENST00000530756 NCAPD3P42695 1498 aa29.31■■■□□ 2.28
BRMS1-208ENST00000530756 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.23■■■□□ 2.27
BRMS1-208ENST00000530756 SMARCA4P51532 1647 aa29.13■■■□□ 2.25
BRMS1-208ENST00000530756 CUX2O14529 1486 aa29.13■■■□□ 2.25
BRMS1-208ENST00000530756 ERCC6Q03468 1493 aa29.12■■■□□ 2.25
BRMS1-208ENST00000530756 NESP48681 1621 aa29.05■■■□□ 2.24
BRMS1-208ENST00000530756 HMGXB3Q12766 1538 aa29.05■■■□□ 2.24
BRMS1-208ENST00000530756 SMARCA2P51531 1590 aa29.04■■■□□ 2.24
BRMS1-208ENST00000530756 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
BRMS1-208ENST00000530756 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
BRMS1-208ENST00000530756 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.83■■■□□ 2.21
BRMS1-208ENST00000530756 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.79■■■□□ 2.2
BRMS1-208ENST00000530756 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
BRMS1-208ENST00000530756 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.65■■■□□ 2.18
BRMS1-208ENST00000530756 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.61■■■□□ 2.17
BRMS1-208ENST00000530756 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.46■■■□□ 2.15
BRMS1-208ENST00000530756 WIZO95785 1651 aa28.42■■■□□ 2.14
BRMS1-208ENST00000530756 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.4■■■□□ 2.14
BRMS1-208ENST00000530756 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.3■■■□□ 2.12
BRMS1-208ENST00000530756 WDR62O43379 1518 aa28.26■■■□□ 2.11
BRMS1-208ENST00000530756 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.12■■■□□ 2.09
BRMS1-208ENST00000530756 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.1■■■□□ 2.09
BRMS1-208ENST00000530756 TRIM41Q8WV44 630 aa28.09■■■□□ 2.09
BRMS1-208ENST00000530756 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
BRMS1-208ENST00000530756 CFTRP13569 1480 aa28.05■■■□□ 2.08
BRMS1-208ENST00000530756 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
BRMS1-208ENST00000530756 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
BRMS1-208ENST00000530756 OSCARQ8IYS5 282 aa27.76■■■□□ 2.03
BRMS1-208ENST00000530756 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.71■■■□□ 2.03
BRMS1-208ENST00000530756 PRDM2Q13029 1718 aa27.69■■■□□ 2.02
BRMS1-208ENST00000530756 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
BRMS1-208ENST00000530756 TOPBP1Q92547 1522 aa27.57■■■□□ 2
BRMS1-208ENST00000530756 IFT140Q96RY7 1462 aa27.56■■■□□ 2
BRMS1-208ENST00000530756 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.52■■■□□ 2
BRMS1-208ENST00000530756 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.52■■■□□ 2
BRMS1-208ENST00000530756 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.52■■■□□ 2
BRMS1-208ENST00000530756 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
BRMS1-208ENST00000530756 ARHGEF11O15085 1522 aa27.41■■□□□ 1.98
BRMS1-208ENST00000530756 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.4■■□□□ 1.98
BRMS1-208ENST00000530756 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
BRMS1-208ENST00000530756 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.36■■□□□ 1.971e-6■■■■□ 24.7
BRMS1-208ENST00000530756 ABCC8Q09428 1581 aa27.34■■□□□ 1.97
BRMS1-208ENST00000530756 CHD1O14646 1710 aa27.29■■□□□ 1.96
BRMS1-208ENST00000530756 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
BRMS1-208ENST00000530756 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.24■■□□□ 1.95
BRMS1-208ENST00000530756 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.2■■□□□ 1.94
BRMS1-208ENST00000530756 ARAP1Q96P48 1450 aa27.16■■□□□ 1.94
BRMS1-208ENST00000530756 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
BRMS1-208ENST00000530756 FBLN2P98095 1184 aa27.15■■□□□ 1.94
BRMS1-208ENST00000530756 SOGA1O94964 1423 aa27.1■■□□□ 1.93
BRMS1-208ENST00000530756 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.07■■□□□ 1.92
BRMS1-208ENST00000530756 CUX1P39880 1505 aa27.05■■□□□ 1.92
BRMS1-208ENST00000530756 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.04■■□□□ 1.92
BRMS1-208ENST00000530756 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.98■■□□□ 1.91
BRMS1-208ENST00000530756 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
BRMS1-208ENST00000530756 WDR97A6NE52 1622 aa26.9■■□□□ 1.9
BRMS1-208ENST00000530756 GRIN2BQ13224 1484 aa26.87■■□□□ 1.89
BRMS1-208ENST00000530756 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
BRMS1-208ENST00000530756 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
BRMS1-208ENST00000530756 SYNJ1O43426 1573 aa26.84■■□□□ 1.89
BRMS1-208ENST00000530756 SYNJ2O15056 1496 aa26.82■■□□□ 1.88
BRMS1-208ENST00000530756 PBRM1Q86U86 1689 aa26.79■■□□□ 1.88
BRMS1-208ENST00000530756 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.76■■□□□ 1.87
BRMS1-208ENST00000530756 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.72■■□□□ 1.87
BRMS1-208ENST00000530756 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.71■■□□□ 1.87
BRMS1-208ENST00000530756 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
BRMS1-208ENST00000530756 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.64■■□□□ 1.86
BRMS1-208ENST00000530756 GRIN2AQ12879 1464 aa26.56■■□□□ 1.84
BRMS1-208ENST00000530756 CEP170Q5SW79 1584 aa26.54■■□□□ 1.84
BRMS1-208ENST00000530756 ADAMTS12P58397 1594 aa26.54■■□□□ 1.84
BRMS1-208ENST00000530756 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.51■■□□□ 1.83
BRMS1-208ENST00000530756 NUP160Q12769 1436 aa26.49■■□□□ 1.83
BRMS1-208ENST00000530756 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.49■■□□□ 1.83
BRMS1-208ENST00000530756 TOP2BQ02880 1626 aa26.48■■□□□ 1.83
BRMS1-208ENST00000530756 SHROOM2Q13796 1616 aa26.41■■□□□ 1.82
BRMS1-208ENST00000530756 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.39■■□□□ 1.82
BRMS1-208ENST00000530756 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.34■■□□□ 1.81
BRMS1-208ENST00000530756 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
BRMS1-208ENST00000530756 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
BRMS1-208ENST00000530756 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.2■■□□□ 1.78
BRMS1-208ENST00000530756 JPH4Q96JJ6 628 aa26.18■■□□□ 1.78
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