Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLNKQ7Z7G1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLNKQ7Z7G1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLNKQ7Z7G1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLNKQ7Z7G1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLNKQ7Z7G1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLNKQ7Z7G1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLNKQ7Z7G1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLNKQ7Z7G1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLNKQ7Z7G1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLNKQ7Z7G1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLNKQ7Z7G1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLNKQ7Z7G1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLNKQ7Z7G1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLNKQ7Z7G1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLNKQ7Z7G1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLNKQ7Z7G1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLNKQ7Z7G1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLNKQ7Z7G1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLNKQ7Z7G1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLNKQ7Z7G1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLNKQ7Z7G1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLNKQ7Z7G1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLNKQ7Z7G1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLNKQ7Z7G1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLNKQ7Z7G1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLNKQ7Z7G1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CLNKQ7Z7G1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLNKQ7Z7G1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLNKQ7Z7G1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLNKQ7Z7G1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLNKQ7Z7G1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLNKQ7Z7G1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLNKQ7Z7G1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLNKQ7Z7G1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLNKQ7Z7G1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLNKQ7Z7G1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLNKQ7Z7G1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLNKQ7Z7G1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLNKQ7Z7G1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLNKQ7Z7G1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLNKQ7Z7G1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLNKQ7Z7G1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLNKQ7Z7G1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLNKQ7Z7G1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLNKQ7Z7G1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLNKQ7Z7G1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLNKQ7Z7G1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CLNKQ7Z7G1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLNKQ7Z7G1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms