Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
CLASP1Q7Z460 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
CLASP1Q7Z460 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
CLASP1Q7Z460 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CLASP1Q7Z460 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
CLASP1Q7Z460 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CLASP1Q7Z460 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
CLASP1Q7Z460 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
CLASP1Q7Z460 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
CLASP1Q7Z460 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
CLASP1Q7Z460 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
CLASP1Q7Z460 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CLASP1Q7Z460 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CLASP1Q7Z460 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CLASP1Q7Z460 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
CLASP1Q7Z460 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
CLASP1Q7Z460 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
CLASP1Q7Z460 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
CLASP1Q7Z460 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CLASP1Q7Z460 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CLASP1Q7Z460 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
CLASP1Q7Z460 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CLASP1Q7Z460 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
CLASP1Q7Z460 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
CLASP1Q7Z460 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
CLASP1Q7Z460 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
CLASP1Q7Z460 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
CLASP1Q7Z460 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
CLASP1Q7Z460 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
CLASP1Q7Z460 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CLASP1Q7Z460 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CLASP1Q7Z460 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CLASP1Q7Z460 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CLASP1Q7Z460 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
CLASP1Q7Z460 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
CLASP1Q7Z460 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
CLASP1Q7Z460 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC41.24■■■■■ 4.19
CLASP1Q7Z460 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
CLASP1Q7Z460 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CLASP1Q7Z460 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
CLASP1Q7Z460 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CLASP1Q7Z460 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
CLASP1Q7Z460 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
CLASP1Q7Z460 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
CLASP1Q7Z460 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
CLASP1Q7Z460 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CLASP1Q7Z460 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CLASP1Q7Z460 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
CLASP1Q7Z460 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.19
CLASP1Q7Z460 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
CLASP1Q7Z460 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CLASP1Q7Z460 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CLASP1Q7Z460 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CLASP1Q7Z460 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CLASP1Q7Z460 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.17■■■■■ 4.18
CLASP1Q7Z460 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CLASP1Q7Z460 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CLASP1Q7Z460 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
CLASP1Q7Z460 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
CLASP1Q7Z460 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC41.16■■■■■ 4.18
CLASP1Q7Z460 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
CLASP1Q7Z460 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CLASP1Q7Z460 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CLASP1Q7Z460 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CLASP1Q7Z460 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CLASP1Q7Z460 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
CLASP1Q7Z460 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
CLASP1Q7Z460 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
CLASP1Q7Z460 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
CLASP1Q7Z460 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC41.13■■■■■ 4.18
CLASP1Q7Z460 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
CLASP1Q7Z460 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CLASP1Q7Z460 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
CLASP1Q7Z460 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
CLASP1Q7Z460 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC41.12■■■■■ 4.17
CLASP1Q7Z460 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CLASP1Q7Z460 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
CLASP1Q7Z460 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CLASP1Q7Z460 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
CLASP1Q7Z460 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CLASP1Q7Z460 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CLASP1Q7Z460 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CLASP1Q7Z460 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CLASP1Q7Z460 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CLASP1Q7Z460 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
CLASP1Q7Z460 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CLASP1Q7Z460 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
CLASP1Q7Z460 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CLASP1Q7Z460 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CLASP1Q7Z460 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CLASP1Q7Z460 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
CLASP1Q7Z460 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
CLASP1Q7Z460 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
CLASP1Q7Z460 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CLASP1Q7Z460 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
CLASP1Q7Z460 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
CLASP1Q7Z460 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CLASP1Q7Z460 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
CLASP1Q7Z460 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
CLASP1Q7Z460 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms