Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SETXQ7Z333 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETXQ7Z333 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms